定 價(jià):45 元
叢書(shū)名:普通高等教育“十二五”規(guī)劃教材
- 作者:施巧琴,吳松剛主編
- 出版時(shí)間:2013/1/1
- ISBN:9787030367389
- 出 版 社:科學(xué)出版社
- 中圖法分類(lèi):Q939.97
- 頁(yè)碼:350
- 紙張:膠版紙
- 版次:1
- 開(kāi)本:16開(kāi)
《工業(yè)微生物育種學(xué)(第四版)》是在《工業(yè)微生物育種學(xué)》第三版的基礎(chǔ)上修訂改編而成的。新版中編入了近年來(lái)工業(yè)微生物育種所采用的新方法和取得的新成果,尤其是在分子定向進(jìn)化育種、基因敲除育種和全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種等方面的許多成功實(shí)例。同時(shí),在第三版原有傳統(tǒng)工業(yè)微生物三大育種技術(shù)——誘變育種、代謝控制育種及雜交育種的基礎(chǔ)上,還補(bǔ)充了工業(yè)微生物生產(chǎn)菌株的培養(yǎng)基優(yōu)化及工程菌株的高密度發(fā)酵技術(shù)等章節(jié),完善了工程菌株目的產(chǎn)物的高效表達(dá)的發(fā)酵工藝過(guò)程,具有實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。
《工業(yè)微生物育種學(xué)(第四版)》可用作高等院校生物工程專(zhuān)業(yè)或相關(guān)專(zhuān)業(yè)教材,也可供相關(guān)科研單位和工廠(chǎng)企業(yè)的科技人員與工程技術(shù)人員參考。
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施巧琴、吳松剛、王明茲、李惠珍、楊建國(guó)、吳偉斌、吳松剛、林俊、林躍鑫、鄭毅、施巧琴、施碧紅、黃欽耿
目錄
第三版序
第二版序
第一版序
第四版前言
第三版前言
第二版前言
第一版前言
第一章 緒論 1
第一節(jié) 工業(yè)微生物育種在生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)中的地位 1
第二節(jié) 工業(yè)微生物育種的進(jìn)展 1
思考題 4
第二章 遺傳物質(zhì)的基礎(chǔ) 5
第一節(jié) 染色體 5
一、染色體形態(tài) 5
二、原核生物及病毒染色體結(jié)構(gòu) 6
三、真核生物染色體結(jié)構(gòu) 7
四、染色體數(shù)目 7
第二節(jié) 核酸 9
一、核酸 9
二、RNA 9
三、DNA 10
第三節(jié) 基因的組織與結(jié)構(gòu) 11
一、基因組 11
二、基因 12
三、遺傳密碼 13
思考題 15
第三章 基因突變 16
第一節(jié) 突變的分子機(jī)制 16
一、基因突變 17
二、染色體畸變和染色體組變 19
第二節(jié) 突變引起遺傳性狀改變及突變型的種類(lèi) 20
一、突變引起遺傳性狀改變 20
二、突變型的種類(lèi) 22
第三節(jié) 突變體的形成 25
一、突變體的形成過(guò)程 26
二、突變的修復(fù) 27
三、突變的表型效應(yīng) 32
四、表型延遲 33
思考題 34
第四章 工業(yè)微生物育種誘變劑 35
第一節(jié) 物理誘變劑 35
一、物理誘變劑的生物學(xué)效應(yīng) 35
二、非電離輻射——紫外線(xiàn) 36
三、電離輻射 39
四、近年來(lái)發(fā)展的新型物理誘變劑 41
第二節(jié) 化學(xué)誘變劑 43
一、堿基類(lèi)似物 44
二、烷化劑 47
三、脫氨劑(以亞硝酸為例) 52
四、移碼誘變劑 54
五、羥化劑(以羥胺為例) 54
六、金屬鹽類(lèi) 55
七、其他化學(xué)誘變劑 55
八、化學(xué)誘變劑的安全操作 57
思考題 57
第五章 工業(yè)微生物產(chǎn)生菌的分離篩選 58
第一節(jié) 含微生物樣品的采集 58
一、從土壤中采樣 58
二、根據(jù)微生物生理特點(diǎn)采樣 60
三、特殊環(huán)境下采樣 61
第二節(jié) 含微生物樣品的富集培養(yǎng) 61
一、控制培養(yǎng)基的營(yíng)養(yǎng)成分 62
二、控制培養(yǎng)條件 62
三、抑制不需要的菌類(lèi) 63
第三節(jié) 好氧微生物的分離 63
一、稀釋涂布分離法和劃線(xiàn)分離法 64
二、利用平皿中的生化反應(yīng)進(jìn)行分離 64
三、組織分離法 67
四、單細(xì)胞或單孢子分離法 68
五、通過(guò)控制營(yíng)養(yǎng)和培養(yǎng)條件進(jìn)行分離 69
第四節(jié) 厭氧微生物的分離 70
第五節(jié) 產(chǎn)目的產(chǎn)物的野生菌的篩選和菌株鑒定 74
一、初篩 74
工業(yè)微生物育種學(xué)
二、復(fù)篩 75
三、菌株鑒定 76
第六節(jié) 極端環(huán)境微生物的分離篩選 76
一、極端環(huán)境微生物的采樣、分離篩選 77
二、極端微生物酶分子生物學(xué)研究 80
第七節(jié) 生物可降解塑料菌株的分離篩選 82
一、生物可降解塑料概況 82
二、獲得生物可降解塑料的微生物途徑和菌株分離方法 83
三、PHA的合成機(jī)制和發(fā)酵特點(diǎn) 85
思考題 85
第六章 工業(yè)微生物誘變育種 86
第一節(jié) 誘變育種的試驗(yàn)設(shè)計(jì)和準(zhǔn)備工作 87
一、誘變前對(duì)出發(fā)菌株的了解 88
二、全面了解菌種特性及其與生產(chǎn)性能的關(guān)系 89
三、了解影響菌種生長(zhǎng)發(fā)育的主要因素 90
四、了解菌種有效產(chǎn)物中的各種組分在代謝合成過(guò)程中與培養(yǎng)條件的關(guān)系 91
五、建立一個(gè)準(zhǔn)確、簡(jiǎn)便、快速檢測(cè)產(chǎn)物的方法 92
六、研究最佳的菌種保藏培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件 92
第二節(jié) 誘變育種的步驟與方法 92
一、出發(fā)菌株的選擇 92
二、出發(fā)菌株的純化 95
三、單孢子(或單細(xì)胞)懸液的制備 96
四、誘變劑及誘變劑量 97
五、誘變劑的處理方法 101
六、影響突變率的因素 103
思考題 105
第七章 工業(yè)微生物變株傳統(tǒng)篩選和高通量篩選 106
第一節(jié) 突變株的傳統(tǒng)分離與篩選 106
一、突變株分離過(guò)篩選的基本環(huán)節(jié) 107
二、篩選的程序 107
三、分離和篩選 108
四、搖瓶液體培養(yǎng) 114
五、產(chǎn)物活性測(cè)定 114
六、搖瓶數(shù)據(jù)的調(diào)整和有關(guān)菌株特性的觀(guān)察分析 116
七、培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件的調(diào)整 117
八、變種的特性研究與鑒定 117
九、誘變育種實(shí)例 119
第二節(jié) 突變株高通量篩選 121
一、常用儀器設(shè)備 121
二、高通量篩選技術(shù)中的常用方法 126
三、高通量篩選應(yīng)用實(shí)例 131
思考題 134
第八章 營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株的篩選 135
第一節(jié) 營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株的分離和篩選 135
一、營(yíng)養(yǎng)缺陷型的誘發(fā) 135
二、淘汰野生型菌株 136
三、營(yíng)養(yǎng)缺陷型的檢出 137
四、營(yíng)養(yǎng)缺陷型的鑒定 138
第二節(jié) 通過(guò)耐結(jié)構(gòu)類(lèi)似物方法篩選高產(chǎn)菌株 142
一、直線(xiàn)合成途徑 144
二、分支途徑 144
思考題 145
第九章 抗噬菌體變株的選育 146
第一節(jié) 抗噬菌體突變株的分離與篩選 146
一、烈性噬菌體及其效價(jià)的測(cè)定 146
二、溫和性噬菌體及溶源菌 147
三、抗噬菌體菌株的選育 148
四、抗性菌株的特性研究 149
第二節(jié) 抗噬菌體菌株的選育實(shí)例 150
一、菌種 150
二、培養(yǎng)基成分 150
三、噬菌體的分離純化和原液制備 151
四、噬菌體菌株的選育 151
五、菌株抗噬菌體性能的檢驗(yàn) 152
六、搖瓶發(fā)酵試驗(yàn) 152
七、發(fā)酵罐發(fā)酵試驗(yàn) 152
思考題 152
第十章 工業(yè)微生物代謝控制育種 153
第一節(jié) 代謝調(diào)節(jié)控制育種 153
一、組成型突變株的選育 154
二、抗分解調(diào)節(jié)突變株的選育 155
三、營(yíng)養(yǎng)缺陷型應(yīng)用于代謝調(diào)節(jié)育種 160
四、滲漏缺陷型應(yīng)用于代謝調(diào)節(jié)育種 164
第二節(jié) 抗反饋調(diào)節(jié)突變株的選育 164
一、回復(fù)突變引起的抗反饋調(diào)節(jié)突變株 164
二、耐自身產(chǎn)物突變株選育 166
三、累積前體和耐前體突變株的選育 167
四、細(xì)胞膜透性突變株的選育 170
思考題 171
第十一章 工業(yè)微生物雜交育種 172
第一節(jié) 微生物雜交 172
一、微生物雜交育種的基本程序 172
二、雜交過(guò)程中親本和培養(yǎng)基的選擇 172
三、雜交育種的遺傳標(biāo)記 174
第二節(jié) 霉菌雜交育種 175
一、霉菌的細(xì)胞結(jié)構(gòu)和繁殖 175
二、霉菌雜交的原理和雜交技術(shù) 176
三、高產(chǎn)重組體的篩選 185
思考題 185
第十二章 工業(yè)微生物原生質(zhì)體融合育種 186
第一節(jié) 微生物原生質(zhì)體融合育種 187
一、直接親本及其遺傳標(biāo)記的選擇 187
二、原生質(zhì)體制備與再生 188
三、原生質(zhì)體融合 196
四、融合體再生 198
五、融合重組體檢出與遺傳特性分析 201
六、原生質(zhì)體融合的應(yīng)用 204
第二節(jié) 放線(xiàn)菌原生質(zhì)體融合育種 205
一、放線(xiàn)菌細(xì)胞壁組成、結(jié)構(gòu)及水解 206
二、放線(xiàn)菌原生質(zhì)體融合育種技術(shù) 206
第三節(jié) 霉菌原生質(zhì)體融合育種 209
一、霉菌原生質(zhì)體制備 211
二、原生質(zhì)體的再生 213
三、原生質(zhì)體融合和再生 213
四、融合重組體分析與鑒定 215
第四節(jié) 工業(yè)微生物基因組改組育種 215
一、微生物基因組改組育種意義和原理 215
二、基因組改組育種技術(shù)及應(yīng)用實(shí)例 218
思考題 222
第十三章 基因工程育種 223
第一節(jié) 概述 223
一、基因工程在微生物育種中的應(yīng)用 224
二、基因工程原理和步驟 225
第二節(jié) 基因工程載體 226
一、質(zhì)粒載體 227
二、λ噬菌體載體 232
三、柯斯質(zhì)粒載體 236
第三節(jié) 基因工程所用的酶 237
一、限制性?xún)?nèi)切核酸酶 238
二、DNA聚合酶 240
三、依賴(lài)于DNA的RNA聚合酶 242
四、連接酶、激酶及磷酸酶 242
五、核酸酶 243
第四節(jié) 基因工程的主要步驟 244
一、DNA的制備 244
二、目的基因的產(chǎn)生與分離 246
三、DNA的連接 247
四、重組體導(dǎo)入大腸桿菌 248
五、含重組質(zhì)粒的細(xì)菌菌落的鑒定 250
六、目的基因的表達(dá)過(guò)程 251
第五節(jié) 基因的表達(dá)系統(tǒng) 253
一、原核表達(dá)系統(tǒng) 253
二、真核生物表達(dá)系統(tǒng) 257
思考題 262
第十四章 分子定向進(jìn)化育種 263
第一節(jié) 理性設(shè)計(jì) 264
一、寡核苷酸引物介導(dǎo)的定點(diǎn)突變 264
二、PCR介導(dǎo)的定點(diǎn)突變 266
三、盒式突變 267
第二節(jié) 非理性設(shè)計(jì)——蛋白質(zhì)(酶)分子定向進(jìn)化技術(shù) 267
一、蛋白質(zhì)(酶)分子定向進(jìn)化的發(fā)展 268
二、蛋白質(zhì)(酶)分子定向進(jìn)化策略 268
三、定向進(jìn)化文庫(kù)的篩選方法 278
四、酶分子工程的應(yīng)用和發(fā)展前景 279
思考題 281
第十五章 基因敲除育種 282
第一節(jié) 基因敲除育種原理 282
一、基因敲除育種概述 282
二、基因重組系統(tǒng) 283
第二節(jié) 工業(yè)微生物基因敲除育種技術(shù)及應(yīng)用 287
一、基因敲除育種技術(shù) 287
二、基因敲除育種技術(shù)的應(yīng)用 289
思考題 291
第十六章 全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種 292
第一節(jié) 全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種的原理 292
第二節(jié) 全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種實(shí)施策略及方法 294
一、全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種實(shí)施策略 294
二、全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種實(shí)施方法 295
第三節(jié) 全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種應(yīng)用實(shí)例 295
第四節(jié) 全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種有關(guān)的其他菌種改造新方法 296
思考題 297
第十七章 工業(yè)微生物生產(chǎn)菌的培養(yǎng)基優(yōu)化 298
第一節(jié) 單因素優(yōu)化方法 298
一、單因素優(yōu)化方法含義 298
二、試驗(yàn)范圍與試驗(yàn)精度 299
第二節(jié) 正交試驗(yàn)優(yōu)化方法 299
一、正交的含義 299
二、正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)的方法 300
三、正交試驗(yàn)結(jié)果 301
第三節(jié) 均勻試驗(yàn)設(shè)計(jì)優(yōu)化方法 304
一、均勻設(shè)計(jì)的特點(diǎn) 305
二、均勻設(shè)計(jì)在培養(yǎng)基優(yōu)化中的應(yīng)用 305
三、均勻設(shè)計(jì)優(yōu)化應(yīng)用實(shí)例 306
四、均勻設(shè)計(jì)的注意事項(xiàng) 308
第四節(jié) 響應(yīng)面優(yōu)化設(shè)計(jì)方法 308
一、響應(yīng)面法的含義及特點(diǎn) 308
二、響應(yīng)面法的應(yīng)用實(shí)例 309
第五節(jié) 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)優(yōu)化方法 314
一、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)優(yōu)化的含義及特點(diǎn) 314
二、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)優(yōu)化在培養(yǎng)基優(yōu)化中的應(yīng)用 314
思考題 315
第十八章 工程菌的高密度發(fā)酵技術(shù) 316
第一節(jié) 工程菌高密度發(fā)酵技術(shù)及其工程學(xué)基礎(chǔ) 316
一、高密度發(fā)酵技術(shù)概述 316
二、高密度發(fā)酵的工程學(xué)基礎(chǔ) 316
第二節(jié) 工程菌高密度發(fā)酵的主要影響因素及其控制 318
一、營(yíng)養(yǎng)成分的影響及其控制 319
二、溫度的影響及其控制 320
三、pH的影響及其控制 321
四、溶氧的影響及其控制 321
五、泡沫的影響及控制 323
六、抑制性代謝副產(chǎn)物的影響及其控制 324
思考題 324
第十九章 工業(yè)微生物菌種的復(fù)壯與保藏 325
第一節(jié) 菌種的退化與復(fù)壯 325
一、菌種退化的原因 326
二、菌種退化的防止 328
三、菌種的復(fù)壯及其方法 331
第二節(jié) 工業(yè)微生物菌種的保藏 331
一、一般菌種保藏 332
二、菌種保藏注意事項(xiàng) 343
思考題 344
主要參考文獻(xiàn) 345
第一章 緒 論
<br>第一節(jié) 工業(yè)微生物育種在生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)中的地位
<br> 工業(yè)微生物菌種選育在生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)中占有重要地位,是決定該發(fā)酵產(chǎn)品能否具有工業(yè)
<br>化價(jià)值及發(fā)酵過(guò)程成敗與否的關(guān)鍵,F(xiàn)代發(fā)酵工業(yè)之所以如此迅猛發(fā)展,除了發(fā)酵工藝改進(jìn)
<br>和發(fā)酵設(shè)備更新之外,更重要的是由于進(jìn)行了菌種的選育及其改良,為發(fā)酵工藝提供了人類(lèi)需
<br>要的各種類(lèi)型的突變菌株,從而使抗生素、酶制劑、氨基酸、有機(jī)酸、維生素、核苷酸、激素、色
<br>素、生物堿、不飽和脂肪酸以及其他生物活性物質(zhì)等產(chǎn)品的產(chǎn)量成倍,甚至成千倍地增長(zhǎng),同時(shí)
<br>產(chǎn)品的質(zhì)量也不斷提高。因此,工業(yè)微生物育種對(duì)于提高生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)產(chǎn)品的產(chǎn)量和質(zhì)量,進(jìn)
<br>一步開(kāi)發(fā)利用微生物資源,增加生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)產(chǎn)品的品種具有重大意義。
<br>用于工業(yè)生產(chǎn)的微生物菌種要具有以下特性。
<br>(1) 在遺傳上必須是穩(wěn)定的。
<br>(2) 易于產(chǎn)生許多營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞、孢子或其他繁殖體。
<br>(3) 必須是純種,不應(yīng)帶其他雜菌及噬菌體。
<br>(4) 種子的生長(zhǎng)必須旺盛、迅速。
<br>(5) 產(chǎn)生所需要的產(chǎn)物時(shí)間短。
<br>(6) 比較容易分離提純。
<br>(7) 有自身保護(hù)機(jī)制,抵抗雜菌污染能力強(qiáng)。
<br>(8) 能保持較長(zhǎng)的良好經(jīng)濟(jì)性能。
<br>(9) 菌株對(duì)誘變劑處理較敏感,從而可能選育出高產(chǎn)菌株。
<br>(10) 在規(guī)定的時(shí)間內(nèi),菌株必須產(chǎn)生預(yù)期數(shù)量的目的產(chǎn)物,并保持相對(duì)地穩(wěn)定。
<br>具備以上條件的菌株,才能保證發(fā)酵產(chǎn)品的產(chǎn)量和質(zhì)量,這是發(fā)酵工業(yè)的最大目的和最低
<br>要求。野生型菌株是不可能具備上述條件的,必須通過(guò)對(duì)野生型菌株的選育才能實(shí)現(xiàn)。發(fā)酵
<br>工業(yè)為人們提供了各種各樣的發(fā)酵產(chǎn)品,而工業(yè)微生物育種為發(fā)酵工業(yè)的上述貢獻(xiàn)奠定了必
<br>不可少的基礎(chǔ)。
<br>第二節(jié) 工業(yè)微生物育種的進(jìn)展
<br>工業(yè)微生物育種,無(wú)論從自然變異中選擇或是人工誘變的選擇,都是建立在遺傳和變異的
<br>基礎(chǔ)上。遺傳和變異是生物界生命活動(dòng)的基本屬性之一。沒(méi)有變異,生物界就失去進(jìn)化的素
<br>材;而沒(méi)有遺傳,變異也無(wú)法積累。同樣,就優(yōu)良菌株的選育來(lái)講,沒(méi)有變異就沒(méi)有選擇的素
<br>材;沒(méi)有遺傳,選到的優(yōu)良性狀也不能進(jìn)行培育。由此可見(jiàn),工業(yè)微生物育種學(xué)是建立在微生
<br>物遺傳學(xué)基礎(chǔ)上,而兩者是相輔相成的。
<br>微生物本身,在漫長(zhǎng)的進(jìn)化過(guò)程中,逐漸達(dá)到適合于它的生存和繁衍的水平。野生型微生
<br>物經(jīng)自然選擇,能適應(yīng)它的周?chē)h(huán)境,能適應(yīng)同其他物種的競(jìng)爭(zhēng),但卻不能按照人的意志生產(chǎn)
<br>人們需要的物質(zhì)。因此,從人類(lèi)的利益出發(fā),必須對(duì)工業(yè)微生物菌種進(jìn)行改良,使之產(chǎn)生數(shù)量
<br>遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出微生物本身需要的物質(zhì),或者不是它正常產(chǎn)生的新物質(zhì)。
<br>對(duì)工業(yè)微生物菌種進(jìn)行有目的的改良,是在有關(guān)微生物遺傳學(xué)知識(shí)被人們了解并掌握之
<br>后才成為可能的。同時(shí),這種改良涉及多學(xué)科領(lǐng)域。
<br>1927 年,人們發(fā)現(xiàn)了X 射線(xiàn)誘發(fā)突變。1945 年后,各種具有誘變能力的輻射和化學(xué)誘變
<br>劑的發(fā)現(xiàn),為這種改良提供了非常有用的工具。通過(guò)誘變和篩選的“隨機(jī)選擇” ,不僅在提高現(xiàn)
<br>有產(chǎn)品的發(fā)酵單位上發(fā)揮了巨大作用,而且在當(dāng)前多種新發(fā)酵產(chǎn)品的改進(jìn)方面也具有很大潛
<br>力。通過(guò)對(duì)誘變作用和DNA 修復(fù)機(jī)制的深入了解,可以設(shè)計(jì)出所希望的突變型的最佳方案。
<br>對(duì)基因表達(dá)和代謝途徑調(diào)控機(jī)制的進(jìn)一步闡明,可以設(shè)計(jì)出使所需要的突變特性得以充分表
<br>達(dá)的篩選條件。自動(dòng)儀表裝置和微機(jī)的應(yīng)用,則可使單位時(shí)間內(nèi)獲得分離的菌株數(shù)量大大增
<br>加。這些技術(shù)的綜合應(yīng)用,使獲得優(yōu)良菌株的概率大為提高。
<br>工業(yè)微生物育種技術(shù)的發(fā)展大致經(jīng)歷如下階段。
<br>隨著微生物學(xué)的發(fā)展,特別是發(fā)明微生物純種培養(yǎng)法之后,開(kāi)始了微生物純種的自然
<br>選育,對(duì)工業(yè)微生物育種有很大的影響。當(dāng)時(shí),在酒精發(fā)酵中,推廣了自然選育的純系良
<br>種,扭轉(zhuǎn)了酒精生產(chǎn)不穩(wěn)定的現(xiàn)象。這是最早應(yīng)用微生物遺傳學(xué)原理于微生物育種實(shí)踐而
<br>提高發(fā)酵產(chǎn)物水平的一個(gè)成功實(shí)例。自然選育方法雖已沿用多年,迄今仍是工業(yè)微生物育
<br>種的手段之一。
<br>由于自然突變頻率低,單純依賴(lài)自然界存在的微生物群體來(lái)進(jìn)行的自然選育無(wú)疑有很大
<br>局限性。繼而進(jìn)行了人工誘變選育,取得了很大效果。
<br>20 世紀(jì)40 年代初,Beadle 和Tatum 采用X 射線(xiàn)和紫外線(xiàn)等輻射因子來(lái)誘變紅色面包
<br>霉等,獲得了各種代謝障礙的變株,并于1941 年提出“一個(gè)基因一種酶”的學(xué)說(shuō),闡述基因
<br>與酶功能的直接關(guān)系,使遺傳學(xué)從細(xì)胞水平發(fā)展到分子水平,促進(jìn)了工業(yè)微生物育種技術(shù)
<br>的發(fā)展。
<br>誘變育種是以人工誘變基因突變?yōu)榛A(chǔ)的,過(guò)去是工業(yè)微生物育種的主要方法,至今仍是
<br>世界各國(guó)行之有效的重要方法,尤其發(fā)酵工業(yè)中的各種優(yōu)良高產(chǎn)菌株絕大部分都是以誘變育
<br>種方法獲得的。例如,抗生素生產(chǎn)中的青霉素產(chǎn)生菌特異青霉( Penicilliumnotatum)是1929
<br>年英國(guó)的Flemirlg 發(fā)現(xiàn)的。當(dāng)時(shí)表層培養(yǎng)只有1~2 U/ml ,而1943年美國(guó)北部地區(qū)研究所實(shí)
<br>驗(yàn)室分離出產(chǎn)黃青霉( Pen.chrysogenum)NRRL9551 同時(shí)伴以沉沒(méi)培養(yǎng)成功,則達(dá)到20U/ ml,在
<br>此基礎(chǔ)上,經(jīng)過(guò)40 多年的誘變育種,到目前已達(dá)80 000 U/ml 以上,比原始菌株的產(chǎn)量提高了
<br>上千倍。至于其他抗生素品種,如鏈霉素、土霉素、四環(huán)素、紅霉素及灰黃霉素等,都由原來(lái)的
<br>幾十單位提高到目前的幾萬(wàn)單位。
<br>除抗生素外,其他許多重要發(fā)酵產(chǎn)品也都由于進(jìn)行了有效的菌種選育工作,在產(chǎn)量和質(zhì)量
<br>上都取得明顯的提高,其主要手段也都是誘變育種。
<br>但是,某一菌株長(zhǎng)期使用誘變劑處理之后,除產(chǎn)生誘變劑“疲勞效應(yīng)”外,還會(huì)引起菌種生
<br>長(zhǎng)周期的延長(zhǎng)、孢子量減少、代謝減慢等,這對(duì)發(fā)酵工藝的控制是不利的。而雜交育種可以作
<br>為育種的另一手段,其成功不僅表現(xiàn)在種內(nèi)雜交上,而且在種間雜交以至屬間雜交都取得令人
<br>滿(mǎn)意的結(jié)果。
<br>雜交育種的最主要目的是把不同菌株的優(yōu)良經(jīng)濟(jì)性狀集中于重組體中,克服長(zhǎng)期用誘變
<br>劑處理造成的上述缺陷,同時(shí)雜交還是增加產(chǎn)品新品種的手段之一。當(dāng)然,雜交育種也應(yīng)當(dāng)建
<br>立在誘變育種的基礎(chǔ)上,沒(méi)有誘變育種,雜交菌株的產(chǎn)量是難以繼續(xù)提高的。
<br>代謝控制育種以20 世紀(jì)50 年代末谷氨酸發(fā)酵取得成功使發(fā)酵工業(yè)進(jìn)入第三轉(zhuǎn)折期――
<br>代謝控制發(fā)酵時(shí)期,并在其后的年代里得到飛躍的發(fā)展。
<br>代謝控制育種活力在于以誘變育種為基礎(chǔ),獲得各種解除或繞過(guò)了微生物正常代謝途徑
<br>的突變株,從而人為地使有用產(chǎn)物選擇性地大量生成和累積。代謝控制育種的崛起標(biāo)志著誘
<br>變育種發(fā)展到理性階段,導(dǎo)致了氨基酸、核苷酸及某些次級(jí)代謝產(chǎn)物的高產(chǎn)菌株大批地投入
<br>生產(chǎn)。
<br>隨著基因工程在工業(yè)微生物菌種選育中的應(yīng)用,世界上以基因工程方法創(chuàng)造的各種工程
<br>菌不計(jì)其數(shù),實(shí)現(xiàn)了人為的菌種選育,一切可以按照人們事先設(shè)計(jì)和控制的方法進(jìn)行育種,這
<br>是一種最新的育種技術(shù)。
<br>基因工程菌的構(gòu)建和應(yīng)用,已在多方面顯示出其巨大的生命力。通過(guò)基因工程的方法生
<br>產(chǎn)藥物―― 已獲得包括治療用藥物、疫苗、單克隆抗體及診斷試劑等多種獲得上市的品種;通
<br>過(guò)基因工程方法提高菌株生產(chǎn)能力―― 已獲得包括氨基酸類(lèi)、工業(yè)用酶制劑及頭孢霉素C 在
<br>內(nèi)的工程菌;通過(guò)基因工程方法改造傳統(tǒng)發(fā)酵工藝―― 如氧傳遞有關(guān)的血紅蛋白基因克隆到
<br>遠(yuǎn)青鏈霉菌,降低了對(duì)氧的敏感性;通過(guò)基因工程方法提高菌種抗性等。以上諸多類(lèi)型的基因
<br>工程菌構(gòu)建,使工業(yè)微生物育種突破了傳統(tǒng)的、經(jīng)典的育種模式,在工業(yè)微生物育種中展示了
<br>極為光明的前景。
<br>基因組改組(genome shuffing)是一種細(xì)胞定向進(jìn)化技術(shù)。2002 年Zhang 等在Nature
<br>上首次發(fā)表了微生物基因組改組育種報(bào)道。基因組改組是多親本微生物之間發(fā)生重組,先用
<br>誘發(fā)突變或點(diǎn)突變技術(shù)產(chǎn)生復(fù)雜子代組合庫(kù),再利用改組技術(shù)將有利性狀組合拼接,快速進(jìn)化
<br>目標(biāo)菌的一種選育微生物的新方法。
<br>基因組改組技術(shù)巧妙地模擬和發(fā)展了自然進(jìn)化過(guò)程,以分子進(jìn)化為核心,用工程學(xué)原理加
<br>以人工設(shè)計(jì),在實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)微生物全細(xì)胞快速定向進(jìn)化,僅需1~2 年就可完成自然界數(shù)百萬(wàn)
<br>年才能達(dá)到的進(jìn)化目標(biāo),使得人們能夠在較短的時(shí)間內(nèi)獲得性狀大幅度改良的正向突變的目
<br>標(biāo)菌株,成為微生物育種的前沿技術(shù)。
<br>分子定向進(jìn)化(directed molecular evolution)是一種DNA水平的分子定向進(jìn)化技術(shù)。20
<br>世紀(jì)90 年代中期美國(guó)Arnold 和Stemmer 首先報(bào)道了蛋白質(zhì)(酶)分子改造成功的例子,從此
<br>拉開(kāi)了酶蛋白分子定向進(jìn)化育種的序幕。分子定向進(jìn)化屬于蛋白質(zhì)(酶)非理性設(shè)計(jì)的主要范
<br>疇,它不需要了解蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)和催化機(jī)制,在實(shí)驗(yàn)室中人為創(chuàng)造特殊的進(jìn)化條件,模擬
<br>自然進(jìn)化機(jī)制,在體外進(jìn)行酶蛋白基因的改造,并定向篩選出所需特性的突變蛋白。這樣就能
<br>在較短時(shí)間內(nèi)完成漫長(zhǎng)的自然進(jìn)化過(guò)程,甚至可以在幾個(gè)月或幾周的時(shí)間內(nèi)創(chuàng)造出優(yōu)化的酶
<br>蛋白,而在自然的進(jìn)化過(guò)程中,要得到這個(gè)結(jié)果需要幾千萬(wàn)年之久。
<br>高通量篩選(high唱throughputscreening)是微生物育種技術(shù)的重要組成部分,在工業(yè)微生
<br>物育種過(guò)程中,無(wú)論是傳統(tǒng)的誘變育種、雜交育種、基因組改組育種、現(xiàn)代基因工程育種及分子
<br>定向進(jìn)化育種等,建庫(kù)后,都要對(duì)文庫(kù)進(jìn)行篩選。而文庫(kù)的庫(kù)容量很大,各個(gè)樣品的質(zhì)量參差
<br>不齊,具有很大的隨機(jī)性。使用傳統(tǒng)零敲碎打的篩選方法,篩選量低,概率小,工作量大,要耗
<br>費(fèi)大量的人力、物力。在這種背景下,高通量篩選技術(shù)孕育而生。
<br>高通量篩選技術(shù)的核心,首先必須根據(jù)目的樣品的特性,開(kāi)發(fā)出合適的篩選模型,將樣品
<br>的這些特性轉(zhuǎn)化成可以用攝像頭和計(jì)算機(jī)傳感器識(shí)別的光信號(hào)或者電信號(hào)。此外,要有自動(dòng)
<br>化或者自動(dòng)化的實(shí)驗(yàn)操作系統(tǒng),能夠進(jìn)行移液、接種、清洗等設(shè)備操作。而且必須具備以下特
<br>點(diǎn):具有在高潔凈度下工作的能力,不引起污染,可多通道一次性進(jìn)行多組操作,操作速度快,
<br>具有良好的軟件和硬件兼容性,能與監(jiān)測(cè)設(shè)備對(duì)接,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)可以在多種軟件平臺(tái)上進(jìn)行分
<br>析,能使用各種通用型規(guī)格的耗材。
<br>隨著工業(yè)微生物育種技術(shù)的不斷創(chuàng)新,尤其分子育種的手段與方法有了嶄新的進(jìn)展,極大
<br>地豐富了工業(yè)微生物育種的內(nèi)容。
<br>在工業(yè)微生物生產(chǎn)菌種基因的表達(dá)系統(tǒng)方面,除了最早采用的原核表達(dá)系統(tǒng)和隨后采用
<br>的酵母表達(dá)系統(tǒng)外,還實(shí)現(xiàn)了絲狀真菌表達(dá)系統(tǒng)和哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng),為工業(yè)微生物工程
<br>菌的構(gòu)建創(chuàng)造了創(chuàng)新性的技術(shù)基礎(chǔ)。
<br>為提高工業(yè)微生物生產(chǎn)菌株的產(chǎn)量,重組載體誘變方法已得以實(shí)現(xiàn),其中質(zhì)粒直接誘變可
<br>通過(guò)化學(xué)誘變劑與質(zhì)粒反應(yīng)時(shí)間的長(zhǎng)短來(lái)控制突變率,篩選目的突變菌株已有成功實(shí)例。
<br>基因敲除是通過(guò)一定的途徑使機(jī)體特定的基因失活或缺失的一種分子生物學(xué)方法,它具
<br>有定位性強(qiáng)、插入基因隨染色體DNA 穩(wěn)定遺傳、操作方便等優(yōu)點(diǎn)。它為定向改造工業(yè)微生物
<br>品種提供了重要的技術(shù)支撐。筆者在闡明芳香族氨基酸代謝途徑的基礎(chǔ)上,通過(guò)敲除L唱色氨
<br>酸菌株的tyrA 基因獲得了酪氨酸營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株,應(yīng)用這種營(yíng)養(yǎng)缺陷型,可使代謝支路的中
<br>間體預(yù)苯酸不流向酪氨酸生成的方向,使色氨酸的合成有充足的原料。發(fā)酵試驗(yàn)結(jié)果顯示:工
<br>程菌的發(fā)酵液中沒(méi)有酪氨酸的存在,同時(shí)L唱色氨酸的產(chǎn)量較原始菌株提高近1 倍,同樣,該技
<br>術(shù)也在L唱苯丙氨酸的工程菌構(gòu)建中取得成功。
<br>全局轉(zhuǎn)錄機(jī)器工程育種是一種通過(guò)引入全局轉(zhuǎn)錄擾動(dòng)來(lái)獲得多尺度細(xì)胞表型突變庫(kù)的新
<br>方法,可以快速、高效地獲得性能顯著提升的細(xì)胞表型重要新技術(shù)。
<br>工業(yè)微生物高密度培養(yǎng),又稱(chēng)高細(xì)胞密度發(fā)酵技術(shù),是在傳統(tǒng)發(fā)酵技術(shù)上改進(jìn)的發(fā)酵技
<br>術(shù),利用一定的培養(yǎng)技術(shù)和裝置,極大地改進(jìn)了發(fā)酵工藝,使菌體密度較普通培養(yǎng)有顯著提高,
<br>增加工程菌對(duì)數(shù)期的生長(zhǎng)時(shí)間、相對(duì)縮短衰亡時(shí)間來(lái)提高菌體的發(fā)酵密度,最終提高產(chǎn)物的比
<br>生產(chǎn)率,不僅可減少培養(yǎng)體積,強(qiáng)化下游分離提取,還可以縮短生產(chǎn)周期,減少設(shè)備投資從而降
<br>低生產(chǎn)成本,極大地提高市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力。
<br>工業(yè)微生物工程菌構(gòu)建成功之后,關(guān)鍵還在于如何在特定的裝備條件下,使其目的產(chǎn)物高
<br>效表達(dá)最大化,其中工業(yè)微生物工程菌的培養(yǎng)基優(yōu)化是使該工程菌株高產(chǎn)性狀及其他優(yōu)良特
<br>性高效表達(dá)的重要發(fā)酵技術(shù),除傳統(tǒng)的正交試驗(yàn)優(yōu)化方法外,均勻?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)優(yōu)化方法、響應(yīng)面
<br>法優(yōu)化設(shè)計(jì)和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)優(yōu)化方法都得到了廣泛的應(yīng)用,并取得了顯著的效果。
<br>縱觀(guān)上述,正由于工業(yè)微生物育種技術(shù)的不斷創(chuàng)新,促進(jìn)了對(duì)生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)總體技術(shù)水平
<br>的提高,不僅使傳統(tǒng)生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)在工藝改進(jìn)、工藝創(chuàng)新和提高產(chǎn)品質(zhì)量等方面起到了重要的
<br>推動(dòng)作用,而且也使現(xiàn)代生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)建立了從被動(dòng)篩選到主動(dòng)合成的技術(shù)平臺(tái),促進(jìn)了我國(guó)
<br>生物發(fā)酵產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
<br>思 考 題
<br>1.簡(jiǎn)述工業(yè)生產(chǎn)的微生物菌種特點(diǎn)。
<br>2.簡(jiǎn)述工業(yè)微生物育種技術(shù)的方法及其特點(diǎn)。
<br>第二章 遺傳物質(zhì)的基礎(chǔ)
<br>生物的性狀由遺傳物質(zhì)決定。隨著遺傳學(xué)的發(fā)展,遺傳物質(zhì)的本質(zhì)不斷被揭示。孟德
<br>爾( G.J.Mendel)1856~1864 年在從事豌豆雜交試驗(yàn)過(guò)程中,首先發(fā)現(xiàn)分離和獨(dú)立分配遺傳
<br>規(guī)律,認(rèn)為生物性狀是受細(xì)胞里的顆粒性遺傳因子控制,但是,這種遺傳因子只是一種邏輯
<br>推理產(chǎn)物,沒(méi)有任何物質(zhì)內(nèi)容。約翰生( W.L.Johannsen)1909 年用“基因” (gene)一詞代替
<br>孟德?tīng)柕倪z傳因子概念,但也沒(méi)有給出“基因”的物質(zhì)內(nèi)容。貝特生( W.Batson)和摩爾根
<br>( T.H.Morgan) 1900~1910 年期間先后在香豌豆、果蠅的遺傳研究中發(fā)現(xiàn)性狀連鎖
<br>(linkage)現(xiàn)象。尤其是摩爾根在大量果蠅遺傳研究基礎(chǔ)上提出了連鎖遺傳規(guī)律,同時(shí),結(jié)合
<br>染色體動(dòng)態(tài)研究結(jié)果提出“基因位于染色體上,基因是染色體的一段片段” 。限于當(dāng)時(shí)的科
<br>學(xué)水平,摩爾根還不能對(duì)基因賦予實(shí)體的內(nèi)容,但他預(yù)見(jiàn)了基因?qū)⑹且粋(gè)化學(xué)實(shí)體。阿委
<br>瑞( O.T.Avery)證明DNA 是遺傳物質(zhì)。沃森(J.D.Watson)和克里克(F.H.C.Crick)于20 世
<br>紀(jì)50 年代前后提出DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)模型,明確了DNA 是遺傳信息的載體,是遺傳物質(zhì),
<br>基因是DNA 分子上的一個(gè)片段。除了DNA 外,有些動(dòng)物、植物病毒和噬菌體是以RNA 作
<br>為遺傳物質(zhì)的。
<br>遺傳物質(zhì)主要分布在真核生物的細(xì)胞核、原核生物的原核中。細(xì)胞質(zhì)中的某些細(xì)胞器,如
<br>葉綠體、線(xiàn)粒體、質(zhì)體等也含有遺傳物質(zhì)。
<br>隨著物理、化學(xué)、分子生物學(xué)等先進(jìn)技術(shù)和設(shè)備的應(yīng)用,對(duì)遺傳物質(zhì)基本單位―― 基因的
<br>本質(zhì)、組織結(jié)構(gòu)等的認(rèn)識(shí)越來(lái)越深入,也賦予基因新的內(nèi)容,形成基因組學(xué)這門(mén)學(xué)科。
<br>第一節(jié) 染 色 體
<br>所有細(xì)胞型生物都具有攜帶基因的結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)稱(chēng)為染色體(chromosome) 。然而,染
<br>色體在原核生物與真核生物之間存在差別:原核生物的染色體由環(huán)狀雙鏈和極少的蛋白質(zhì)構(gòu)
<br>成,細(xì)胞中僅有單個(gè)染色體,每個(gè)染色體有單一的DNA 復(fù)制起始位點(diǎn),染色體包含在核質(zhì)體
<br>中。真核生物有若干條線(xiàn)性染色體,DNA 與大量的蛋白質(zhì)緊密結(jié)合,每一真核生物具有多個(gè)
<br>DNA 復(fù)制起始位點(diǎn),染色體包含在細(xì)胞核中。
<br>一、染色體形態(tài)
<br>根據(jù)著絲粒的位置可以把染色體分為四種典型的形態(tài),它們分別是:① 中著絲粒染色體:
<br>其著絲粒位于染色體中部附近,染色體具有幾乎等長(zhǎng)的兩臂;② 近中著絲粒染色體:其著絲粒
<br>位置偏離染色體中位,染色體具有長(zhǎng)、短兩臂;③ 端著絲粒染色體:其著絲粒位于染色體的端
<br>部,染色體只有一個(gè)臂;④ 近端著絲粒染色體:其著絲粒幾乎位于染色體的端部,染色體有一個(gè)
<br>長(zhǎng)臂,有一個(gè)極短的短臂(圖2.1) 。
<br>所有真核生物的染色體具有著絲粒和端粒這兩個(gè)重要區(qū)域。此外,某些染色體還具有核
<br>仁形成區(qū)。著絲粒在細(xì)胞分裂過(guò)程中,作為紡錘
<br>絲的附著點(diǎn),缺乏著絲粒,細(xì)胞將無(wú)法進(jìn)行正常的
<br>分裂。
<br>端粒不僅是染色體末端的一個(gè)區(qū)域,它還具
<br>有特殊的結(jié)構(gòu)。在端粒區(qū)域,含有DNA 重復(fù)序列
<br>(repeat sequence) ,如人類(lèi)的該序列為T(mén) TAGGG 。
<br>在生殖細(xì)胞中,每個(gè)端粒含有大量的重復(fù)序列,但
<br>是隨著體細(xì)胞衰老,端粒中的重復(fù)序列數(shù)量逐漸
<br>減少。維持端粒長(zhǎng)度的恒定要靠端粒酶。研究發(fā)
<br>現(xiàn),在體細(xì)胞中缺少端粒酶,但在腫瘤細(xì)胞中重新
<br>出現(xiàn)了端粒酶。
<br>核仁形成區(qū)通常存在于次縊痕區(qū)。該區(qū)含有
<br>重復(fù)的rRNA 基因,在細(xì)胞分裂間期,核仁形成區(qū)
<br>解凝聚,其周?chē)纬珊巳省?br /><br>二、原核生物及病毒染色體結(jié)構(gòu)
<br>以大腸桿菌為例來(lái)闡明原核生物染色體的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。
<br>大腸桿菌染色體以單個(gè)雙鏈環(huán)狀DNA 分子構(gòu)成,大約有4.6 × 106 bp 。這種染色體組成
<br>了大腸桿菌的擬核(核質(zhì)體) 。在擬核中DNA 占80 % ,其余為RNA 和蛋白質(zhì)。DNA 與蛋白
<br>質(zhì)相互作用形成“腳手架”形結(jié)構(gòu)(圖2.2) 。在這種結(jié)構(gòu)中,DNA 鏈形成了50~100 個(gè)功能域
<br>或環(huán)。每個(gè)環(huán)都是超螺旋結(jié)構(gòu),每個(gè)環(huán)的DNA 有兩個(gè)端點(diǎn)被蛋白質(zhì)固定。每個(gè)環(huán)大約有
<br>50~100kb 。當(dāng)用微量的DNA 酶Ⅰ 處理,會(huì)使少量DNA 環(huán)成為松弛狀態(tài),而其他環(huán)保持超螺
<br>旋狀態(tài)不變。
<br>染色體環(huán)狀DNA 功能域?qū)⑦M(jìn)一步與DNA 結(jié)合蛋白結(jié)合。在DNA 結(jié)合蛋白質(zhì)中,含量
<br>最豐富的為HU 蛋白,另外還有H唱NS 蛋白。這些蛋白質(zhì)有時(shí)也稱(chēng)為類(lèi)組蛋白。
<br>病毒沒(méi)有典型的染色體結(jié)構(gòu)。習(xí)慣上把病毒含有的RNA 或DNA 也稱(chēng)為染色體。對(duì)DNA
<br>病毒來(lái)說(shuō),不同的病毒其DNA 形態(tài)結(jié)構(gòu)多種多樣,如DNA 可以是單鏈,也可以是雙鏈;可以是
<br>環(huán)狀,也可以是線(xiàn)狀。對(duì)RNA 病毒來(lái)說(shuō),RNA 為線(xiàn)狀,RNA 可以為單鏈,也可以為雙鏈,甚至含
<br>