花青素代謝途徑調(diào)控復(fù)合體及其順式元件的分析
定 價(jià):58 元
- 作者:祝志欣
- 出版時(shí)間:2019/1/1
- ISBN:9787511639363
- 出 版 社:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)出版社
- 中圖法分類:Q945.11
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- 紙張:膠版紙
- 版次:
- 開本:16開
本研究以花色模式植物圓葉牽牛(Ipomoeapurpurea)的花青素代謝途徑為主要研究對(duì)象,深入解析其調(diào)控復(fù)合物IpMYB1-IpbHLH2-IpWDR1對(duì)應(yīng)在相關(guān)靶基因啟動(dòng)子上的順式元件,并在模式植物擬南芥(Arabidopsisthaliana)中對(duì)部分研究結(jié)論進(jìn)行了檢驗(yàn)。隨后本研究將考察對(duì)象擴(kuò)展到其它已有部分研究數(shù)據(jù)的被子植物,包括紫玉蘭(Magnolialiliflora)、玉米(Zeamays)和非洲菊(Gerberahybrida)這些代表被子植物主要類群的物種,試圖從轉(zhuǎn)錄因子和順式調(diào)控元件兩個(gè)方面探尋花青素代謝途徑在表達(dá)調(diào)控上的特點(diǎn)及可能存在的進(jìn)化信號(hào)。
前 言花青素(anthocyanin)是大部分被子植物花朵顏色的決定性色素,可使花朵呈現(xiàn)出粉、紅、紫、藍(lán)等一系列顏色。同時(shí),它與葉綠素(chlorophyll)和類胡蘿卜素(carotenoid)配合,也可以使植物的果實(shí)和葉片呈現(xiàn)出五彩斑斕的著色模式。植物美麗的色彩不僅有觀賞價(jià)值,更對(duì)植物的生活有直接的作用。鮮艷的花朵和果實(shí)可以幫助植物吸引傳粉者和果實(shí)傳播者,有利于植物的繁殖。紅色的葉片則可以保護(hù)植物對(duì)抗紫外線、病蟲害以及食草動(dòng)物的進(jìn)食等。對(duì)人類而言,花青素是一種天然強(qiáng)效的自由基清除劑,具有抗氧化、抗突變、預(yù)防心腦血管疾病、保護(hù)肝臟、抑制腫瘤等多種保健功能。在心血管疾病和癌癥頻發(fā)的現(xiàn)代社會(huì),各種富含花青素的食物品種也受到人們的青睞;ㄇ嗨貙儆谥参锏拇紊x產(chǎn)物,由一系列結(jié)構(gòu)基因編碼的酶催化合成。這一系列結(jié)構(gòu)基因構(gòu)成了花青素合成途徑,是被子植物中較為保守的一個(gè)途徑,可以被眾多的環(huán)境因素誘導(dǎo)表達(dá)。多個(gè)物種的研究表明,由MYB、bHLH和WDR三類調(diào)控因子(TFs)組成的MBW復(fù)合體調(diào)控著花青素代謝途徑上眾多結(jié)構(gòu)基因,讓它們得以協(xié)同地表達(dá);虻谋磉_(dá)調(diào)控是基因功能得以實(shí)現(xiàn)的重要過程,基因間的協(xié)同表達(dá)是基因組整體功能的重要方面。關(guān)于花青素代謝途徑中結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)和調(diào)控基因的功能已有較廣泛的研究,但對(duì)于MBW復(fù)合體如何協(xié)同調(diào)控整個(gè)途徑眾多基因的表達(dá)還不太清楚。以上疑問的解決,關(guān)鍵在于結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控基因之間的聯(lián)結(jié)紐帶順式調(diào)控元件。深入比較花青素代謝途徑上眾多靶基因?qū)?yīng)于MBW復(fù)合體的順式調(diào)控元件,對(duì)于人們從整體的角度了解基因組內(nèi)代謝途徑的調(diào)控具有重要的意義。本書以花色模式植物圓葉牽牛(Ipomoea purpurea)的花青素代謝途徑為主要研究對(duì)象,深入解析其MBW調(diào)控復(fù)合體在相關(guān)靶基因啟動(dòng)子上對(duì)應(yīng)的順式元件,直觀展現(xiàn)了花青素代謝途徑多個(gè)基因啟動(dòng)子上順式元件的排列組合,這些順式元件的分布差異直接影響了花青素代謝途徑上基因的表達(dá)水平。隨后本研究將考察對(duì)象擴(kuò)展到其他植物類群,試圖從轉(zhuǎn)錄因子和順式調(diào)控元件兩個(gè)方面探尋花青素代謝途徑在表達(dá)調(diào)控上的特點(diǎn)及可能存在的進(jìn)化信號(hào)。對(duì)于調(diào)控花青素代謝途徑的MBW復(fù)合體,研究發(fā)現(xiàn),MYB的表達(dá)是花青素積累的關(guān)鍵:①M(fèi)BW復(fù)合體的靶基因眾多。一方面包括了復(fù)合體本身的兩個(gè)成員bHLH和WDR,另一方面也包括了途徑上的幾乎所有核心結(jié)構(gòu)基因,以及下游的部分修飾、轉(zhuǎn)運(yùn)基因如3GGT等。②MYB單獨(dú)對(duì)以上靶基因具有弱激活功能,使得植物在信號(hào)誘導(dǎo)下產(chǎn)生特異的MYB后,可以反饋性地完成復(fù)合體中另兩個(gè)成員bHLH和WDR的積累。③由MYB、bHLH和WDR形成的MBW復(fù)合體對(duì)靶基因的激活能力相對(duì)于單獨(dú)MYB有大幅的提高,可以有效地開啟花青素合成、修飾和轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因的表達(dá)。對(duì)于MBW復(fù)合體中MYB和bHLH對(duì)應(yīng)的順式元件,研究發(fā)現(xiàn)它們均有較大的變異范圍,分別總結(jié)為MRE[MYB識(shí)別序列,ANCNN(C/A)C]和BRE[bHLH識(shí)別序列,CACNN(G/T)]。這可以允許MBW復(fù)合體識(shí)別多個(gè)靶基因。此外,MRE和BRE在靶基因啟動(dòng)子上的組合排列可以直接影響該靶基因的轉(zhuǎn)錄激活水平。紫玉蘭(Magnolia liliflora)、玉米(Zea mays)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、非洲菊(Gerbera hybrida)和圓葉牽牛代表了被子植物主要類群的物種。對(duì)它們MBW調(diào)控復(fù)合體成員的比較表明,花青素代謝途徑并非是普遍保守的。在被子植物內(nèi),不論是調(diào)控因子的調(diào)節(jié)強(qiáng)度還是啟動(dòng)子的反應(yīng)性都經(jīng)歷著緩慢而深刻的進(jìn)化。就代謝途徑上的各基因而言,啟動(dòng)子的不同可以引起基因間表達(dá)的差異,這種差異大于調(diào)控因子分化帶來的影響;對(duì)物種間同源的結(jié)構(gòu)基因而言,轉(zhuǎn)錄因子間的分化則是基因表達(dá)強(qiáng)度變化的一個(gè)重要因素。本書在多年課題研究的基礎(chǔ)上總結(jié)撰寫而成,在撰寫過程中,得到了魯迎青研究員的悉心指導(dǎo);肖大洲老師對(duì)本書的出版也做了不少輔助工作,在此一并表示感謝!本書引用了大量的相關(guān)文獻(xiàn),其中大多數(shù)已在書中注明出處,但難免有所疏漏。在此,向有關(guān)作者和專家表示感謝,并對(duì)沒有注明出處的作者表示歉意。本書的出版由海南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.317012)、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31660074)、海南大學(xué)科研啟動(dòng)基金(No.kyqd1840)共同資助完成,在此表示誠摯的感謝。本書對(duì)花青素代謝途徑進(jìn)行了直觀的描述,研究結(jié)果對(duì)認(rèn)識(shí)花青素代謝途徑的調(diào)控具有良好的促進(jìn)作用。對(duì)植物花色、葉色和果色感興趣的植物愛好者、觀賞植物的育種工作者以及研究基因調(diào)控的科研工作者,本書可作為參考書籍。盡管本書在撰寫過程中力求邏輯嚴(yán)謹(jǐn),內(nèi)容充實(shí),但由于著者水平有限,難免有所疏漏,懇請(qǐng)各位專家、同仁和廣大的讀者批評(píng)指正,以便今后完善。著 者2018年10月于海南大學(xué)
祝志欣,女,1986年4月出生,湖北武漢市人,植物學(xué)博士,現(xiàn)任海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院講師。2015年7月畢業(yè)于中科院植物研究所,獲植物學(xué)博士學(xué)位。2015年9月至今在海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院從事教學(xué)和科研工作。教學(xué)課程主要為《生物化學(xué)》、《植物生理學(xué)》、《植物生理生化》的理論及實(shí)驗(yàn)?蒲蟹矫嬉恢睆氖轮参锘ㄇ嗨丶邦慄S酮代謝網(wǎng)絡(luò)的調(diào)控研究,研究物種主要為圓葉牽牛和甘薯。目前主持國家自然科學(xué)基金1項(xiàng),負(fù)責(zé)海南省自然科學(xué)基金1項(xiàng),以第一或通訊作者發(fā)表多篇論文,分別刊于JournalofExperimentalBotany,PlantMethods、植物學(xué)報(bào)、南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)、熱帶作物學(xué)報(bào)等。
1 緒 論 …………………………………………………………………1
1.1 基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 …………………………………………………1
1.2 花青素代謝途徑及其調(diào)控 ………………………………………11
1.3 花青素代謝途徑改變導(dǎo)致的顏色變異 …………………………22
1.4 花青素途徑調(diào)控研究中存在的問題和本研究的目的 …………27
2 圓葉牽;ㄇ嗨卮x途徑基因啟動(dòng)子克隆及序列分析 ……29
2.1 引 言 ……………………………………………………………29
2.2 材料和方法 ………………………………………………………29
2.3 結(jié) 果 ……………………………………………………………34
2.4 討 論 ……………………………………………………………44
3 圓葉牽;ㄇ嗨卮x途徑MBW調(diào)控復(fù)合體的功能研究
及其靶基因的確定 …………………………………………………46
3.1 引 言 ……………………………………………………………46
3.2 材料和方法 ………………………………………………………47
3.3 結(jié) 果 ……………………………………………………………56
3.4 討 論 ……………………………………………………………61
4 圓葉牽;ㄇ嗨卮x途徑基因啟動(dòng)子MBW復(fù)合體
相關(guān)順式元件的解析 ………………………………………………64
4.1 引 言 ……………………………………………………………64
4.2 材料和方法 ………………………………………………………64
4.3 結(jié) 果 ……………………………………………………………68
4.4 討 論 ……………………………………………………………87
5 被子植物MBW復(fù)合體的進(jìn)化初探 ………………………………90
5.1 引 言 ……………………………………………………………90
5.2 材料和方法 ………………………………………………………92
5.3 結(jié) 果 ……………………………………………………………96
5.4 討 論 ……………………………………………………………102
6 結(jié)論與展望 ……………………………………………………………105
6.1 結(jié) 論 ……………………………………………………………105
6.2 展 望 ……………………………………………………………108
附 錄 ………………………………………………………………………110
參考文獻(xiàn) ……………………………………………………………………121