在校長辦公室里抓到了國民黨特務(wù)，學(xué)生的情緒如同火上澆油。學(xué)生會宣布從19日開始罷課，如交涉無結(jié)果，全體同學(xué)到南京請愿，罷免丁文淵。丁文淵也不讓步，18日宣布開除五名學(xué)生，21日又開除四名學(xué)生，處分三十人。并發(fā)出《告學(xué)生書》，逼迫學(xué)生結(jié)束罷課，恢復(fù)秩序。教育部次長杭立武表態(tài)支持丁文淵，并盼學(xué)“持緩和態(tài)度”。26日，教育部長朱家驊趕到上海，與丁文淵等密談。朱說，此次學(xué)潮非一般罷課事件可比，具有嚴(yán)重之政治性，從學(xué)生要求修改部頒自治會規(guī)則可以概見。希望學(xué)生從速復(fù)課，如再堅持，不惜解散同濟(jì)大學(xué)。鑒于矛盾已經(jīng)不可調(diào)和，學(xué)生會決定：如果28日交涉仍無結(jié)果，同濟(jì)學(xué)生將于29日全體到南京請愿抗議。28日深夜，上海市警察局長俞平叔來到同濟(jì)，做最后的勸阻，遭到學(xué)生拒絕。
29日凌晨，國民黨軍警將同濟(jì)工學(xué)院團(tuán)團(tuán)包圍，禁止學(xué)生走出校門。四輛裝甲車把住了各個路口，騎警的馬隊虎視眈眈。千余名同濟(jì)學(xué)生在校門口高呼口號，復(fù)旦、交大等學(xué)校前來送行和聲援的學(xué)生站在街上，與同濟(jì)學(xué)生隔著墻互相喊話，表示支持。相持幾小時后，10時20分，同濟(jì)學(xué)生沖出校門，來到其美路上與軍警對峙。
眼看學(xué)生要沖破封鎖，市長吳國楨出面了。他向?qū)W生喊道：你們同濟(jì)的事，我一直很關(guān)心。到南京請愿，可推舉代表十人，我可以保護(hù)。但是不能集體請愿，這是違法的。學(xué)生高呼：根據(jù)憲法，人民有請愿的自由。吳國楨說：根據(jù)維持社會秩序緊急法，請愿不能超過十人。然后，他叫學(xué)生代表一起到旁邊的康隴酒坊談判。從十一時到午后三時，談判一直在拖延。吳國楨談笑自如，而丁文淵一直露面。這顯然是拖延時間，要把學(xué)生累垮。在學(xué)生群中的中共地下黨員吳學(xué)謙、喬石等商量，不能上當(dāng)，要采取行動。這時，一個學(xué)生與警察發(fā)生沖突被捕，學(xué)生頓時憤怒起來，集體向前沖。吳國楨出來時，學(xué)生們向警察馬隊拋擲石塊，一時形勢大亂。有學(xué)生抓住吳國楨，打掉了他的帽子和眼鏡。并將他推倒在地。這時警察高喊：市長被打了！掏槍準(zhǔn)備射擊。吳國楨怕釀成血案，趕緊喊：不準(zhǔn)開槍！這時，擔(dān)任談判代表的地下黨員馮立文感到如果事態(tài)發(fā)展下去，將會導(dǎo)致嚴(yán)重后果，使學(xué)生在政治上處于被動。他一把拉起了吳國楨，立刻有警察趕來把吳護(hù)送走。
警察的馬隊在學(xué)生群中往來沖撞，揮舞棍棒，打傷踏傷學(xué)生多人，還有部分學(xué)生被警察捕去。手無寸鐵的學(xué)生難以與武裝軍警對抗，學(xué)生會指揮學(xué)生和外校同學(xué)退人工學(xué)院內(nèi)。這時，吳國楨指著學(xué)生代表說：像這種行為，簡直是有意造成事件。他強(qiáng)硬提出：交出今天帶頭鬧事的學(xué)生，交出被開除的學(xué)生，立即復(fù)課。指揮軍警的上海警備司令宣鐵吾也氣勢洶洶地說：毆打行政長官，應(yīng)當(dāng)嚴(yán)辦。這時，丁文淵才來到。他根本不是來解決問題，而是配合吳國楨、宣鐵吾鎮(zhèn)壓學(xué)生的。
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