本書收入日本公、私博物館及個人收藏之吐魯番文書目錄, 以收藏單位為單元進行排列, 以京都、東京、奈良、大阪和其他各地所藏為序。
20世紀以來，吐魯番出土文書流散到世界各地，鄰國日本是收藏最豐的國家。本書作者經過十余年的艱苦努力，對流散到日本的吐魯番出土文書進行了搜集和整理，并擬題編目。全書對于日本一些收藏頗豐、已有過全面擬題的編目，在充分尊重日本學者成果的基礎上加以登錄和補充，對于一些沒有編目的館藏，則依據每件圖版做了新的訂題編目。
總前言
日本收藏卷前言
凡例
京都龍谷大學大宮圖書館藏大谷文書
京都龍谷大學藏橘瑞超文書
《流沙殘闕》所收吐魯番文書
《西域考古圖譜》所刊、未入大谷藏吐魯番文書
京都國立博物館藏吐魯番文書
京都大學文學部藏吐魯番文書
京都大學文學部羽田紀念館藏吐魯番文書照片
京都大學文學部藏題“中村不折氏舊藏”回鶻文文書照片
京都橋本關雪紀念館藏吐魯番文書
京都大學日比野丈夫新獲見藏吐魯番文書
東京國立博物館藏吐魯番文書
東京書道博物館藏吐魯番文書
東京靜嘉堂文庫藏吐魯番文書
奈良寧樂美術館藏吐魯番文書
奈良天理大學圖書館藏吐魯番文書
大阪四天王寺出口常順藏吐魯番文書
靜岡縣磯部武男藏吐魯番文書
上野淳一藏吐魯番文書
三井八郞右衛(wèi)門藏吐魯番文書
日本散見吐魯番文書
附錄：京都藤井有鄰館藏文書
吐魯番文書研究參考論著目錄
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