第1章 核酸的結構與性質
1.1 DNA的結構
1.1.1 DNA的化學組成
1.1.2 DNA雙螺旋
1.1.3 DNA結構的多態(tài)性
1.2 DNA超螺旋
1.2.1超螺旋DNA
1.2.2共價閉合環(huán)狀DNA的拓撲結構
1.2.3超螺旋密度
1.2.4拓撲異構酶
1.2.5嵌入劑
1.3 DNA的變性和復性
1.3.1 DNA變性
1.3.2復性
1.4RNA結構
第1章 核酸的結構與性質
1.1 DNA的結構
1.1.1 DNA的化學組成
1.1.2 DNA雙螺旋
1.1.3 DNA結構的多態(tài)性
1.2 DNA超螺旋
1.2.1超螺旋DNA
1.2.2共價閉合環(huán)狀DNA的拓撲結構
1.2.3超螺旋密度
1.2.4拓撲異構酶
1.2.5嵌入劑
1.3 DNA的變性和復性
1.3.1 DNA變性
1.3.2復性
1.4RNA結構
第2章 基因組DNA
2.1原核生物的基因組和染色體
2.1.1原核生物基因組的遺傳結構
2.1.2原核生物的染色體
2.2真核生物的基因組
2.2.1真核生物的C值矛盾與非編碼DNA
2.2.2真核生物基因組的序列組分
2.3真核生物的染色體和染色質
2.3.1組蛋白
2.3.2核小體
2.3.3從核小體到中期染色體
2.3.4異染色質與常染色質
2.3.5真核生物染色體DNA上的幾個重要元件
2.4核外基因組
2.4.1質�；蚪M
2.4.2線粒體基因組
2.4.3葉綠體基因組
第3章 DNA的復制
3.1 DNA復制的一般特征
3.1.1半保留復制
3.1.2復制起點與復制子
3.1.3 DNA合成的引發(fā)
3.1.4半不連續(xù)復制
3.1.5滾環(huán)復制與D環(huán)復制
3.2大腸桿菌染色體DNA的復制
3.2.1復制的起始
3.2.2復制的延伸
3.2.3復制的終止
3.2.4復制起始調控
3.3真核生物DNA復制
3.3.1 SV40 DNA的復制
3.3.2真核生物基因組復制的調控
3.3.3核小體的組裝
3.3.4端粒DNA復制
3.4反轉錄
3.4.1反轉錄病毒的結構
3.4.2反轉錄病毒的基因組
3.4.3反轉錄過程
3.4.4原病毒DNA的整合
第4章 DNA的突變、損傷和修復
4.1 DNA突變
4.1.1突變的主要類型
4.1.2突變的產生
4.1.3正向突變、回復突變與突變的校正
4.1.4突變熱點
4.2 DNA修復
4.2.1光復活
4.2.2烷基的轉移
4.2.3核苷酸切除修復
4.2.4堿基切除修復
4.2.5錯配修復
4.2.6極小補丁修復
4.2.7重組修復
4.2.8SOS反應
4.2.9真核生物的DNA修復
第5章 DNA重組
5.1同源重組
5.1.1同源重組的分子模型
5.1.2大腸桿菌的同源重組
5.1.3真核細胞的同源重組
5.1.4交配型轉換
5.1.5基因轉換
5.2位點特異性重組
5.3轉座
5.3.1 DNA轉座子
5.3.2反轉錄轉座子
5.3.3 Mu噬菌體
第6章 RNA的生物合成
6.1原核生物的轉錄機制
6.1.1大腸桿菌RNA聚合酶
6.1.2σ70啟動子
6.1.3原核生物的轉錄
6.2真核生物的轉錄機制
6.2.1真核生物RNA聚合酶
6.2.2 RNA Pol Ⅰ基因的轉錄
6.2.3 RNA Pol Ⅲ基因的轉錄
6.2.4 RNA Pol Ⅱ基因的轉錄
第7章 轉錄后加工
7.1真核生物前體mRNA的加工
7.1.15′端加帽
7.1.23′端加尾
7.1.3剪接
7.1.4 RNA編輯
7.1.5 RNA運出細胞核
7.2 mRNA降解
7.2.1原核生物mRNA的降解
7.2.2真核生物mRNA的降解
7.3前體rRNA和前體tRNA的加工
7.3.1原核生物rRNA前體的加工
7.3.2真核生物rRNA前體的加工
7.3.3原核生物tRNA前體的加工
7.3.4真核生物tRNA前體的加工
7.4四種內含子的比較
7.4.1細胞核前體mRNA的GUAG型內含子
7.4.2Ⅰ型內含子
7.4.3Ⅱ型內含子
7.4.4真核生物前體tRNA內含子
第8章 蛋白質的生物合成
8.1遺傳密碼
8.1.1遺傳密碼是三聯體
8.1.2遺傳密碼的破譯
8.1.3密碼子的特性
8.2 tRNA
8.2.1 tRNA分子的二級結構
8.2.2 tRNA分子的三級結構
8.2.3密碼子和反密碼子的相互作用
8.3氨酰tRNA合成酶
8.3.1氨酰tRNA合成酶催化的化學反應
8.3.2氨酰tRNA合成酶的分類
8.3.3氨酰tRNA合成酶對tRNA的識別
8.3.4氨酰tRNA合成酶的校正功能
8.4核糖體
8.4.1核糖體的結構
8.4.2核糖體循環(huán)
8.4.3肽酰轉移酶反應
8.5多肽鏈的合成
8.5.1原核生物多肽鏈的合成
8.5.2真核生物多肽鏈的合成
8.6反式翻譯
8.6.1 tmRNA的結構與功能
8.6.2反式翻譯的分子模型
8.7程序性核糖體移碼
8.8硒代半胱氨酸
8.9吡咯賴氨酸
8.10依賴翻譯的mRNA質量監(jiān)控
8.10.1無義密碼子介導的mRNA降解
8.10.2無終止密碼子介導的mRNA降解
8.11蛋白質合成的抑制劑
8.12蛋白質翻譯后加工
8.12.1蛋白質的折疊
8.12.2蛋白質的化學修飾
8.12.3蛋白質的酶解切割
8.12.4內含肽與蛋白質拼接
8.13蛋白質的定向與分揀
8.13.1翻譯?轉運途徑
8.13.2翻譯后轉運途徑
8.14蛋白質的降解
8.14.1溶酶體降解途徑
8.14.2泛素?蛋白酶體途徑
第9章 原核生物基因表達的調控
9.1轉錄水平的基因表達調控
9.1.1轉錄起始調控
9.1.2轉錄終止階段的調控
9.2翻譯水平的調控
9.2.1反義RNA
9.2.2核糖體蛋白的自體控制
9.2.3一些mRNA分子必須經過切割才能被翻譯
9.2.4嚴緊反應
9.3核開關
9.4 DNA重排對基因轉錄的調控
9.5λ噬菌體調控級聯
9.5.1裂解周期中的級聯調控
9.5.2溶源生長的自體調控
9.5.3溶源生長建立的分子機制
9.5.4裂解生長和溶源生長的選擇
9.5.5前噬菌體的誘導
第10章 真核生物基因表達的調控
10.1染色質的結構與基因表達
10.1.1位置效應
10.1.2活性染色質的形態(tài)特征
10.1.3染色質結構的調節(jié)
10.1.4染色質結構的區(qū)間性
10.2 DNA甲基化與基因組活性調控
10.2.1真核生物DNA的甲基化
10.2.2 DNA甲基化與基因沉默
10.2.3 DNA甲基化與基因組印記
10.2.4 X染色體失活
10.3真核生物的特異性轉錄因子
10.3.1轉錄因子的分離與鑒定
10.3.2轉錄因子的功能域
10.4轉錄因子的作用方式
10.4.1活化子
10.4.2抑制子
10.5轉錄因子活性的調節(jié)
10.5.1轉錄因子的表達調控
10.5.2信號分子對轉錄因子活性的調節(jié)
10.6轉錄后水平的基因表達調控
10.7翻譯水平的基因表達調控
10.7.1 mRNA結合蛋白對翻譯的調控
10.7.2翻譯激活因子對翻譯的激活作用
10.8 DNA重排與抗體基因的組裝
10.8.1抗體的分子結構
10.8.2抗體基因的結構及其重排
10.9 RNA介導的基因沉默
10.9.1 RNA干擾
10.9.2轉錄后基因沉默
10.9.3雙鏈RNA對基因組的調節(jié)
10.9.4微小RNA
第11章 分子生物學方法Ⅰ
11.1核酸的分離、純化、檢測和雜交
11.1.1 DNA的分離和純化
11.1.2 DNA凝膠電泳
11.1.3脈沖場凝膠電泳
11.1.4變性梯度凝膠電泳
11.1.5 DNA的化學合成
11.1.6完整基因的化學合成
11.1.7肽核酸
11.1.8用紫外線檢測DNA和RNA的濃度
11.1.9核酸的放射性標記
11.1.10放射性標記DNA的檢測
11.1.11 DNA和RNA的熒光檢測
11.1.12用生物素和地高辛標記DNA
11.1.13Southern和Northern印跡雜交
11.1.14熒光原位雜交
11.1.15分子信標
11.2基因克隆
11.2.1工具酶
11.2.2基因克隆的載體
11.2.3基因文庫
11.3聚合酶鏈式反應
11.3.1 PCR簡介
11.3.2簡并引物
11.3.3反向PCR
11.3.4 PCR產物的克隆
11.3.5隨機擴增多態(tài)性DNA
11.3.6反轉錄PCR
11.3.7差異顯示PCR
11.3.8快速cDNA末端擴增
11.3.9定點突變
11.3.10 PCR介導產生融合基因
11.3.11實時熒光定量PCR
第12章 分子生物學方法Ⅱ
12.1 DNA測序和基因組測序
12.1.1 DNA測序
12.1.2基因組測序
12.2基因表達分析
12.2.1報告基因
12.2.2上游序列的缺失分析
12.2.3確定上游調控區(qū)中的蛋白質結合位點
12.2.4轉錄起始位點的確定
12.2.5轉錄組分析
12.3蛋白質組學
12.3.1蛋白質電泳
12.3.2雙向PAGE電泳
12.3.3蛋白質Western印跡
12.3.4蛋白質標簽系統(tǒng)
12.3.5噬菌體展示
12.3.6酵母雙雜交系統(tǒng)
12.3.7免疫共沉淀
參考文獻
書單推薦
