目錄
序
前言
第1章 緒論 1
1.1 微生物生態(tài)學的研究范圍 1
1.2 微生物生態(tài)學的發(fā)展 3
1.3 微生物生態(tài)學的意義 7
1.4 環(huán)境微生物生態(tài)學概述 8
1.5 土壤環(huán)境微生物生態(tài)學研究現(xiàn)狀 9
1.6 淡水環(huán)境微生物生態(tài)學研究現(xiàn)狀 10
1.7 大氣環(huán)境微生物生態(tài)學研究現(xiàn)狀 12
1.8 固體廢棄物環(huán)境微生物生態(tài)學研究現(xiàn)狀 13
1.9 微生物在地球化學循環(huán)中的作用 14
1.10 微生物與污染物的相互關(guān)系 17
思考題 18
參考文獻 19
第2章 環(huán)境微生物生態(tài)學研究方法 25
2.1 微生物群落研究方法 25
2.2 微生物群落多樣性分析方法 34
思考題 36
參考文獻 36
第3章 活性污泥環(huán)境微生物生態(tài) 41
3.1 污水處理廠nirS型反硝化菌群結(jié)構(gòu)與脫氮特性 41
3.1.1 研究對象及意義 41
3.1.2 實驗材料 42
3.1.3 實驗方法 43
3.1.4 結(jié)果與分析 45
3.2 基于13C穩(wěn)定同位素標記診斷好氧反硝化細菌代謝通路 55
3.2.1 研究對象及意義 55
3.2.2 實驗材料 56
3.2.3 實驗方法 56
3.2.4 結(jié)果與分析 59
思考題 67
參考文獻 67
第4章 飲用水管道環(huán)境微生物生態(tài) 71
4.1 飲用水管道微生物概述 71
4.1.1 飲用水中細菌增殖的危害 71
4.1.2 飲用水主要污染來源 73
4.1.3 我國地表水體環(huán)境質(zhì)量標準 74
4.1.4 飲用水中的細菌標準 75
4.1.5 自來水中細菌數(shù)量檢測方法 77
4.2 飲用水管道環(huán)境微生物研究路徑 78
4.2.1 滯留與溫度誘導室內(nèi)飲用水管道細菌增殖 79
4.2.2 飲用水中龐大而復雜的微生物群落 80
4.2.3 管材及流速對飲用水中細菌增殖特征的影響 81
4.2.4 飲用水處理工藝對細菌增殖的影響 82
4.2.5 機會致病菌 82
4.3 主要研究方法 83
4.3.1 生物化學發(fā)光儀檢測水中 ATP 83
4.3.2 碳源代謝指紋技術(shù)測定微生物活性 83
4.3.3 高通量測序技術(shù) 84
4.4 滯留飲用水管道細菌增殖季相演替 85
4.4.1 材料與方法 85
4.4.2 飲用水管道過夜滯留水體細菌再增長的季相演替 86
4.4.3 定量評估滯留前后水體生物穩(wěn)定性的季相演替 87
4.4.4 微生物碳源代謝指紋技術(shù)表征細菌活性的季相變化 88
4.4.5 水體滯留前后細菌多樣性分析 92
4.4.6 水體細菌群落結(jié)構(gòu)組成分析 93
思考題 99
參考文獻 100
第5章 好氧反硝化脫氮微生物生態(tài) 104
5.1 研究對象及意義 104
5.2 實驗材料 106
5.3 實驗方法 107
5.4 結(jié)果與分析 112
5.4.1 細菌生長曲線及 TOC和氮去除率的測定 112
5.4.2 反硝化參數(shù)的優(yōu)化 117
5.4.3 混合培養(yǎng)好氧反硝化細菌的組成和動力學 120
5.4.4 硝酸鹽與TOC的共去除與相互作用 122
5.4.5 對實際污水的處理特性 123
思考題 125
參考文獻 125
第6章 景觀水體環(huán)境微生物生態(tài) 129
6.1 典型景觀水體水質(zhì)和 nirS型反硝化菌群結(jié)構(gòu) 129
6.1.1 實驗材料 130
6.1.2 實驗方法 131
6.1.3 結(jié)果與討論 132
6.2 城市內(nèi)湖沉積物酶活性和微生物代謝特征 140
6.2.1 材料與方法 140
6.2.2 結(jié)果與分析 144
思考題 149
參考文獻 150
第7章 測序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析 153
7.1 分子生物學在環(huán)境微生物生態(tài)學中的應(yīng)用 153
7.1.1 環(huán)境微生物的多樣性分析 153
7.1.2 環(huán)境微生物的功能性質(zhì)和基因表達分析 155
7.2 微生物組數(shù)據(jù)的擴增子和宏基因組分析 157
7.2.1 微生物組分析的高通量測序方法 158
7.2.2 擴增子測序和宏基因組測序流程 160
7.3 微生物組數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析和可視化 162
7.3.1 微生物組數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析 162
7.3.2 微生物組數(shù)據(jù)統(tǒng)計及可視化實例 172
思考題 196
參考文獻 196