前言
第1章 群體遺傳學概述
1.1 歷史背景
1.2 遺傳變異檢測
1.3 群體遺傳進化的基本動力
1.4 林木群體遺傳學研究的基本問題
復習思考題
第2章 哈迪—溫伯格定律
2.1 群體概念
2.2 基因型與基因頻率估計
2.2.1 分子標記選用
2.2.2 遺傳抽樣與統(tǒng)計抽樣
2.2.3 基因型和基因頻率估計方法
2.2.4 自助樣方法
2.3 哈迪—溫伯格平衡（HWE）
2.3.1 基因型頻率與基因頻率關(guān)系
2.3.2 哈迪―溫伯格平衡檢驗
2.4 連鎖不平衡LD
2.4.1 配子LD
2.4.2 高階LD
2.4.3 LD檢驗
2.4.4 產(chǎn)生LD的過程
2.5 交配系統(tǒng)分析
2.6 Wahlund效應(yīng)
2.7 分析軟件介紹
復習思考題
第3章 遺傳漂變
3.1 遺傳漂變過程
3.1.1 基因頻率變化趨勢
3.1.2 基因溯祖過程
3.2 有效群體大小Ne
3.2.1 Ne概念及影響因素
3.2.2 應(yīng)用分子標記估計N
3.3 瓶頸效應(yīng)
3.4 遺傳漂變與突變互作
3.4.1 無限等位基因模型
3.4.2 無限位點模型
3.4.3 中性和近中性理論
3.4.4 中性理論檢驗
3.5 遺傳漂變與重組互作
3.5.1 IBD區(qū)段分布
3.5.2 LD沿基因組變化
3.6 遺傳漂變與定向選擇互作
3.6.1 優(yōu)勢基因丟失概率
3.6.2 弱勢基因固定概率
3.7 分析軟件介紹
復習思考題
第4章 群體遺傳結(jié)構(gòu)
4.1 植物群體結(jié)構(gòu)形成基礎(chǔ)
4.1.1 基因擴散障礙
4.1.2 動植物群體結(jié)構(gòu)形成差異
4.2 群體結(jié)構(gòu)模型
4.2.1 島嶼模型
4.2.2 Stepping-stone模型
4.2.3 距離隔離模型
4.3 漸變?nèi)?br> 4.4 譜系地理變異
4.4.1 分子方差分析
4.4.2 地理結(jié)構(gòu)存在測驗
4.4.3 統(tǒng)計簡約網(wǎng)絡(luò)
4.4.4 嵌套枝分析
4.4.5 譜系分選
4.5 種群基因流估計
4.6 Nei氏遺傳距離
4.7 花粉流與種子流
4.8 種間基因漸滲
4.8.1 ABBA-BABA檢驗
4.8.2 TreeMix分析
4.8.3 IM模型
4.8.4 IIM模型
4.8.5 AFS模型分析
4.8.6 ABC分析
4.9 基因流與突變互作
4.10 分析軟件介紹
復習思考題
第5章 自然選擇
5.1 自然選擇的遺傳基礎(chǔ)
5.1.1 選擇度量
5.1.2 適合度組成
5.1.3 選擇類型
5.2 選擇檢測
5.2.1 相繼世代基因型頻率變化
5.2.2 DNA序列變異
5.2.3 數(shù)量性狀變異
5.2.4 基于選擇與其他進化過程互作途徑
5.2.5 小結(jié)
5.3 選擇與其他進化過程互作
5.3.1 選擇與遺傳漂變互作
5.3.2 選擇與基因流互作
5.3.3 選擇與突變互作
5.3.4 選擇與交配系統(tǒng)互作
5.4 分析軟件介紹
復習思考題
第6章 數(shù)量性狀變異與進化
6.1 數(shù)量性狀變異的遺傳基礎(chǔ)
6.1.1 數(shù)量性狀遺傳變異
6.1.2 遺傳方差與基因頻率關(guān)系
6.1.3 QTL定位分析
6.2 親屬間的相似性
6.2.1 親屬間相關(guān)性
6.2.2 方差成分和遺傳力估計
6.3 遺傳增益與分子標記應(yīng)用
6.3.1 遺傳增益
6.3.2 分子標記輔助選擇
6.3.3 基因組選擇
6.3.4 育種值預測
6.4 數(shù)量性狀遺傳變異維持與進化
6.4.1 進化方程
6.4.2 遺傳變異維持
6.4.3 遺傳保護中保持進化的潛勢
6.5 分析軟件介紹
復習思考題
第7章 群體遺傳學在樹木改良與遺傳保護中的應(yīng)用
7.1 背景
7.2 樹木改良
7.3 種源試驗
7.4 遺傳標記
7.5 如何研究地理變異
7.6 地理變異模式
7.7 遺傳保護
7.7.1 抽樣策略
7.7.2 案例分析
7.8 小結(jié)
復習思考題
參考文獻
附錄
附錄1 專業(yè)詞匯表
附錄2 物種學名