手性β-氨基醇生物催化合成實(shí)驗(yàn)技術(shù)
本書(shū)主要介紹手性β-氨基醇及其生物催化合成方法,對(duì)手性β-氨基醇的應(yīng)用及其合成方法進(jìn)行了概述,全面系統(tǒng)地介紹了在手性β-氨基醇生物合成方面取得的重要成果,讓讀者充分了解手性β-氨基醇的生物催化合成方法。本書(shū)從原理到應(yīng)用,結(jié)構(gòu)嚴(yán)謹(jǐn),內(nèi)容緊跟前沿,知識(shí)面廣,且有一定的理論深度,充分反應(yīng)了手性β-氨基醇的發(fā)展動(dòng)態(tài),體現(xiàn)了新興生物催化領(lǐng)域的新發(fā)展趨勢(shì)。
本書(shū)可供從事化學(xué)化工﹑生物工程﹑制藥工程等專業(yè)的高等院校﹑科研機(jī)構(gòu)﹑企業(yè)的師生﹑研究人員和工程技術(shù)人員參考使用。
張建棟,太原理工大學(xué),副教授,博士畢業(yè)于華東理工大學(xué)生物化工專業(yè),在新加坡國(guó)立大學(xué)從事博士后工作2年。主要研究方向?yàn)椋荷锎呋c轉(zhuǎn)化、合成生物學(xué)。目前在太原理工大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院從事教學(xué)科研工作。作為項(xiàng)目負(fù)責(zé)人主持自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、山西省自然科學(xué)青年科技研究基金、生物反應(yīng)器工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放項(xiàng)目、山西省高等學(xué)校科技創(chuàng)新項(xiàng)目、校青年基金項(xiàng)目、太原理工大學(xué)人才引進(jìn)科研啟動(dòng)項(xiàng)目各一項(xiàng)。在研期間一直從事生物催化方面的研究,在微生物的篩選、基因克隆表達(dá)、酶催化性能、蛋白質(zhì)工程、多酶級(jí)聯(lián)催化、產(chǎn)物分離純化等方面都具有良好的工作基礎(chǔ)和豐富的工作經(jīng)驗(yàn),并已在相關(guān)國(guó)內(nèi)外期刊上發(fā)表學(xué)術(shù)論文30余篇,平均影響因子大于3.3,授權(quán)專利3項(xiàng)。
第一章 手性β-氨基醇概述 1
1.1 手性β-氨基醇簡(jiǎn)介 2
1.2 手性β-氨基醇的應(yīng)用 2
1.3 手性β-氨基醇的合成 3
1.3.1 化學(xué)法合成手性β-氨基醇 3
1.3.2 生物法合成手性β-氨基醇 9
參考文獻(xiàn) 19
第二章 β-氨基醇特異性轉(zhuǎn)氨酶高通量篩選方法的建立 26
2.1 引言 27
2.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 27
2.2.1 菌株來(lái)源 27
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑 28
2.2.3 實(shí)驗(yàn)儀器 28
2.3 實(shí)驗(yàn)方法 28
2.3.1 顯色反應(yīng)條件探究 28
2.3.2 篩選方法靈敏度探究 29
2.3.3 轉(zhuǎn)氨酶的篩選 30
2.3.4 分析方法 30
2.4 結(jié)果與分析 30
2.4.1 顯色條件 30
2.4.2 篩選方法的靈敏度 33
2.4.3 全細(xì)胞空白對(duì)照 34
2.4.4 轉(zhuǎn)氨酶的篩選 34
2.5 小結(jié) 35
參考文獻(xiàn) 35
第三章 惡臭假單胞菌ω-轉(zhuǎn)氨酶基因的克隆及其在手性β-氨基醇合成中的應(yīng)用 36
3.1 惡臭假單胞菌中ω-轉(zhuǎn)氨酶基因的克隆與重組表達(dá) 37
3.1.1 引言 37
3.1.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 37
3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法 39
3.1.4 結(jié)果與分析 42
3.1.5 小結(jié) 47
3.2 惡臭假單胞菌ω-轉(zhuǎn)氨酶酶學(xué)性質(zhì)表征及其底物特異性研究 48
3.2.1 引言 48
3.2.2 實(shí)驗(yàn)材料 48
3.2.3 實(shí)驗(yàn)方法 49
3.2.4 結(jié)果與分析 52
3.2.5 小結(jié) 58
參考文獻(xiàn) 59
第四章 結(jié)核分枝桿菌轉(zhuǎn)氨酶(MVTA)的克隆及其在手性β-氨基醇合成中的應(yīng)用 60
4.1 引言 61
4.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 61
4.2.1 菌株與質(zhì)粒 61
4.2.2 試劑盒 61
4.2.3 實(shí)驗(yàn)試劑 61
4.2.4 實(shí)驗(yàn)儀器 62
4.2.5 培養(yǎng)基及其他試劑配制 63
4.3 實(shí)驗(yàn)方法 64
4.3.1 引物設(shè)計(jì)及目的基因的PCR擴(kuò)增 64
4.3.2 轉(zhuǎn)氨酶MVTA表達(dá)載體的構(gòu)建及目的蛋白質(zhì)的表達(dá)與純化 65
4.3.3 酶活力測(cè)定方法 67
4.3.4 轉(zhuǎn)氨酶MVTA酶活力的最適反應(yīng)pH及pH穩(wěn)定性 68
4.3.5 轉(zhuǎn)氨酶MVTA酶活力的最適反應(yīng)溫度及溫度穩(wěn)定性 68
4.3.6 轉(zhuǎn)氨酶MVTA動(dòng)力學(xué)參數(shù)和對(duì)映選擇性測(cè)定 68
4.3.7 轉(zhuǎn)氨酶MVTA不對(duì)稱胺化α-羥基酮氨基供體的篩選 69
4.3.8 轉(zhuǎn)氨酶MVTA不對(duì)稱胺化α-羥基酮 70
4.3.9 不同濃度二甲基亞砜對(duì)反應(yīng)的影響 70
4.3.10 不同濃度R-苯乙胺對(duì)反應(yīng)的影響 70
4.3.11 產(chǎn)物L(fēng)-苯甘氨醇對(duì)反應(yīng)的影響 71
4.3.12 產(chǎn)物苯乙酮對(duì)反應(yīng)的影響 71
4.3.13 反應(yīng)過(guò)程中底物濃度、反應(yīng)時(shí)間和細(xì)胞用量對(duì)反應(yīng)的影響 71
4.3.14 制備S構(gòu)型苯甘氨醇 71
4.3.15 分析方法 71
4.4 結(jié)果與分析 72
4.4.1 重組載體的構(gòu)建 72
4.4.2 MVTA目的蛋白質(zhì)的表達(dá)及純化 73
4.4.3 轉(zhuǎn)氨酶的最適pH 73
4.4.4 轉(zhuǎn)氨酶pH穩(wěn)定性 74
4.4.5 轉(zhuǎn)氨酶的最適溫度 74
4.4.6 轉(zhuǎn)氨酶溫度穩(wěn)定性 75
4.4.7 MVTA動(dòng)力學(xué)參數(shù)和對(duì)映選擇性測(cè)定 76
4.4.8 MVTA動(dòng)力學(xué)拆分外消旋β-氨基醇 77
4.4.9 不對(duì)稱胺化α-羥基酮氨基供體的選擇 78
4.4.10 pH對(duì)不對(duì)稱還原胺化反應(yīng)的影響 78
4.4.11 溫度對(duì)不對(duì)稱還原胺化反應(yīng)的影響 78
4.4.12 助溶劑二甲基亞砜(DMSO)濃度對(duì)不對(duì)稱還原胺化反應(yīng)的影響 79
4.4.13 底物濃度和產(chǎn)物濃度對(duì)不對(duì)稱還原胺化反應(yīng)的影響 80
4.4.14 細(xì)胞用量對(duì)不對(duì)稱還原胺化反應(yīng)的影響 80
4.4.15 MVTA不對(duì)稱胺化α-羥基酮 81
4.4.16 制備S-苯甘氨醇 82
4.5 小結(jié) 83
參考文獻(xiàn) 84
第五章 巨大芽孢桿菌轉(zhuǎn)氨酶BMTA的克隆及其在手性鄰氨基醇合成中的應(yīng)用 85
5.1 引言 86
5.2 實(shí)驗(yàn)部分 87
5.2.1 材料與試劑 87
5.2.2 實(shí)驗(yàn)方法 87
5.2.3 分析方法 90
5.3 結(jié)果與討論 90
5.3.1 ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA的表達(dá)、純化和酶活檢測(cè) 90
5.3.2 pH對(duì)ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA活性及穩(wěn)定性的影響 91
5.3.3 溫度對(duì)ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA活性及穩(wěn)定性的影響 91
5.3.4 ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA的底物特異性 92
5.3.5 ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA動(dòng)力學(xué)拆分外消旋?-氨基醇 93
5.3.6 ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA不對(duì)稱還原胺化羥酮 93
5.3.7 ω-轉(zhuǎn)氨酶BMTA動(dòng)力學(xué)拆分外消旋苯甘氨醇制備(S)-苯甘氨醇 94
5.4 小結(jié) 94
參考文獻(xiàn) 94
第六章 羰基還原酶組合轉(zhuǎn)氨酶級(jí)聯(lián)催化外消旋β-氨基醇同時(shí)制備手性β-氨基醇和手性鄰二醇 95
6.1 羰基還原酶的克隆與表達(dá) 96
6.1.1 引言 96
6.1.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 96
6.1.3 分析方法 98
6.1.4 實(shí)驗(yàn)方法 99
6.1.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 103
6.1.6 小結(jié) 107
6.2 羰基還原酶酶學(xué)性質(zhì)表征 107
6.2.1 引言 107
6.2.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 108
6.2.3 分析方法 108
6.2.4 實(shí)驗(yàn)方法 109
6.2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 110
6.2.6 小結(jié) 115
6.3 羰基還原酶與葡萄糖脫氫酶在E.coli中共表達(dá)及不對(duì)稱還原?-羥酮 116
6.3.1 引言 116
6.3.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 117
6.3.3 分析方法 117
6.3.4 實(shí)驗(yàn)方法 118
6.3.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析 121
6.3.6 小結(jié) 128
6.4 級(jí)聯(lián)生物催化外消旋β-氨基醇同時(shí)制備手性β-氨基醇和鄰二醇 129
6.4.1 引言 129
6.4.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 129
6.4.3 實(shí)驗(yàn)方法 130
6.4.4 分析方法 132
6.4.5 結(jié)果與分析 132
6.4.6 小結(jié) 139
參考文獻(xiàn) 140
第七章 環(huán)氨基醇特異性脫氨酶產(chǎn)生菌的篩選及其應(yīng)用于手性環(huán)氨基醇的合成 141
7.1 高活力高選擇性環(huán)氨基醇脫氨酶產(chǎn)生菌的篩選 142
7.1.1 引言 142
7.1.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 142
7.1.3 實(shí)驗(yàn)方法 144
7.1.4 結(jié)果與分析 148
7.1.5 小結(jié) 154
7.2 節(jié)桿菌環(huán)己胺氧化酶的克隆及其酶學(xué)性質(zhì)表征 155
7.2.1 引言 155
7.2.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器 155
7.2.3 實(shí)驗(yàn)方法 157
7.2.4 結(jié)果與分析 162
7.2.5 小結(jié) 170
參考文獻(xiàn) 171
第八章 生物催化環(huán)氧化物不對(duì)稱開(kāi)環(huán)制備手性β-氨基醇 172
8.1 醇脫氫酶的篩選 173
8.1.1 引言 173
8.1.2 實(shí)驗(yàn)材料 174
8.1.3 實(shí)驗(yàn)方法 177
8.1.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析 180
8.1.5 小結(jié) 182
8.2 立體選擇性級(jí)聯(lián)生物催化外消旋二醇合成手性β-氨基醇 183
8.2.1 引言 183
8.2.2 實(shí)驗(yàn)材料 183
8.2.3 實(shí)驗(yàn)方法 185
8.2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 187
8.2.5 小結(jié) 191
8.3 三酶共表達(dá)重組菌的構(gòu)建及催化苯乙二醇合成手性β-氨基醇 191
8.3.1 引言 191
8.3.2 實(shí)驗(yàn)材料 191
8.3.3 實(shí)驗(yàn)方法 192
8.3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 195
8.3.5 小結(jié) 198
8.4 多酶級(jí)聯(lián)催化環(huán)氧化物不對(duì)稱開(kāi)環(huán)合成手性β-氨基醇 198
8.4.1 引言 198
8.4.2 實(shí)驗(yàn)材料 199
8.4.3 實(shí)驗(yàn)方法 200
8.4.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 212
8.4.5 小結(jié) 222
參考文獻(xiàn) 223
第九章 級(jí)聯(lián)生物催化烯烴不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇的研究 224
9.1 引言 225
9.2 實(shí)驗(yàn)材料 225
9.2.1 實(shí)驗(yàn)藥品 225
9.2.2 培養(yǎng)基 226
9.2.3 實(shí)驗(yàn)儀器 226
9.3 實(shí)驗(yàn)方法 227
9.3.1 重組大腸桿菌的構(gòu)建 227
9.3.2 重組大腸桿菌的誘導(dǎo)表達(dá) 228
9.3.3 目的蛋白質(zhì)的酶活力檢測(cè) 228
9.3.4 凍干酶粉的制備 229
9.3.5 多酶級(jí)聯(lián)體系催化烯烴1a不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇5a的條件優(yōu)化 229
9.3.6 多酶級(jí)聯(lián)體系催化烯烴1a~j不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇5a~j 230
9.3.7 共表達(dá)體系的構(gòu)建 231
9.3.8 兩種重組大腸桿菌細(xì)胞催化烯烴不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇 235
9.3.9 共表達(dá)細(xì)胞催化烯烴不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇 236
9.3.10 E.coli(CGS-DEM)和E.coli(CGS-DEB)制備手性β-氨基醇 237
9.3.11 氣相色譜分析法 237
9.4 結(jié)果與討論 239
9.4.1 重組大腸桿菌的構(gòu)建 239
9.4.2 多酶級(jí)聯(lián)催化烯烴1a不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇5a的條件優(yōu)化 240
9.4.3 多酶級(jí)聯(lián)催化烯烴1a~j不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇5a~j 242
9.4.4 共表達(dá)體系的構(gòu)建 243
9.4.5 兩種重組大腸桿菌細(xì)胞催化烯烴不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇 245
9.4.6 共表達(dá)細(xì)胞催化烯烴不對(duì)稱胺羥化合成手性β-氨基醇 247
9.4.7 E.coli(CGS-DEM)和E.coli(CGS-DEB)制備手性β-氨基醇 249
9.5 小結(jié) 249
參考文獻(xiàn) 250