《神農本草經疏》共三十卷，卷一、卷二有《續(xù)序例》上、下，《續(xù)序例》上有論文三十余篇及諸病應忌藥總例，《續(xù)序例》下為陰陽表里虛實門、五臟六腑門、六淫門、婦人門、小兒門、外科等各科主證用藥，卷三至卷五為玉石部．卷六至卷十一為草部，卷十二至卷十四為木部，卷十五為人部，卷十六至卷十八為獸部，卷十九為禽部，卷二十至卷二十二為蟲魚部，卷二十三為果部，卷二十四至卷二十六為米谷部，卷二十七至卷二十九為菜部，卷三十為補遺。每味藥列有“疏”、“主治參互”、“簡誤”等項。
《神農本草經疏》內容切于實用，有“《經疏》出而《本草》亡”之說。宜于初學者學習、掌握，是中醫(yī)藥院校師生及臨床醫(yī)生必備的參考書。