研究不能心存功利在鄭永飛的諸多科研成果中，特別值得一提的是，他的《礦物氧同位素分餾系數(shù)的理*計算和實驗測定》是在一等獎空缺的情況下，與其他27項成果共同榮獲2004年度國家自然科學(xué)二等獎的。
　　此次獲獎成果是由26篇系列學(xué)**文組成的，這些*文都發(fā)表在**地球化學(xué)刊物上，是他12年研究*文的集合。
　　“學(xué)問不能有功利思想，科學(xué)研究既需要創(chuàng)新，又需要積累，要有十年磨一劍的耐力和甘于寂寞的勇氣�！闭勂皤@得的國家自然科學(xué)二等獎，鄭永飛感慨地說，“科研需要靜下心來思考，一旦有了功利思想，就很難出大成果、成就大事業(yè)。”
　　礦物穩(wěn)定同位素分餾系數(shù)的確定是公認(rèn)的世界性難題，鄭永飛早在南京大學(xué)攻讀碩士學(xué)位期間就潛心于此，直到在德國哥廷根大學(xué)留學(xué)期間取得突破。早期，人們用統(tǒng)計力學(xué)方法計算氣體分子的同位素分餾系數(shù)，但它對于固體礦物不適用。以后人們通過實驗測定或自然觀察進(jìn)行校準(zhǔn)，而由于受條件限制只能得到零散的結(jié)果。20世紀(jì)80年代初，有人提出了一種增量方法，即用礦物結(jié)晶化學(xué)原理計算硅酸礦物之間氧同位素分餾系數(shù)，但其結(jié)果與實驗數(shù)據(jù)和自然觀察相比，仍然存在較大的偏差，更不能應(yīng)用于同位素地質(zhì)測溫。
　　鄭永飛迎難而上，緊緊盯住學(xué)科發(fā)展前沿，不斷探索著將這一領(lǐng)域的研究向前推進(jìn)。他獨(dú)辟蹊徑，從理*和實踐兩個方面同時推進(jìn)自己的研究，將礦物結(jié)晶化學(xué)理*與量子化學(xué)原理相結(jié)合，科學(xué)地修正了前人的增量方法，在理*上完善了礦物晶體結(jié)構(gòu)和化學(xué)成分與氧同位素配分之間的函數(shù)關(guān)系，對地質(zhì)上若干重要固體礦物的氧同位素分餾系數(shù)進(jìn)行了理*計算，先后在**學(xué)*期刊上發(fā)表了3篇*文，這3篇*文后來成為地球化學(xué)領(lǐng)域的經(jīng)典*文。在德國圖賓根大學(xué)博士后研究期間，他選擇同位素分餾系數(shù)的實驗測定作為主攻方向，繼續(xù)深化這個研究領(lǐng)域。
　　1993年秋，鄭永飛回到中國科大工作。安家、建實驗室、組建團(tuán)隊、買設(shè)備、申請經(jīng)費(fèi)一切白手起家。盡管條件比較簡陋，一切尚處起步階段，但憑借科學(xué)家的直覺和對學(xué)*研究前沿的敏銳把握，在*、國家自然科學(xué)基金委和學(xué)校等多方資助和支持下，鄭永飛教授拓展了自己在國外的高**工作，自己動手和指導(dǎo)研究生繼續(xù)修正增量方法，對地質(zhì)上有用的其他礦物進(jìn)行了氧同位素分餾系數(shù)的理*計算，對礦物和巖石的化學(xué)成分和晶體結(jié)構(gòu)效應(yīng)進(jìn)行了定量評價，取得了與實驗測定和自然觀察相一致的結(jié)果。與此同時，他指導(dǎo)研究生進(jìn)行低溫化學(xué)合成，從實驗角度測定了一些難于在高溫條件下測定的礦物分餾系數(shù)。
　　十年磨一劍，厚積薄發(fā)�；�于該項研究，鄭永飛研究團(tuán)隊共發(fā)表了28篇高質(zhì)量學(xué)**文，并被*同行廣泛引用（SCI檢索他引計837次）。1997年，美國出版的《地球化學(xué)原理》教科書中，就有7頁篇幅專門用來詳細(xì)介紹增量方法的基本原理、計算公式和方程以及主要結(jié)果圖表。世界上幾個*出版社出版的《礦床地球化學(xué)》和《穩(wěn)定同位素地球化學(xué)》等教科書或系列專著也對該方法進(jìn)行了簡介。大年初一為學(xué)生改*文在潛心科研的同時，鄭永飛也非常重視教學(xué)和研究生培養(yǎng)工作，除了承擔(dān)著高年級本科生和研究生的專業(yè)課外，還指導(dǎo)著十幾名博士、碩士研究生。只要一有空閑，他都會來到學(xué)生們身邊，和他們一起討*、一起交*，共話科學(xué)與人生。
　　“導(dǎo)師是研究生從事科研活動的*榜樣，這是我指導(dǎo)研究生人、學(xué)問的基本出發(fā)點(diǎn)�！睆闹笇�(dǎo)研究生閱讀專業(yè)文獻(xiàn)，到帶領(lǐng)研究生進(jìn)行野外地質(zhì)考察，設(shè)計室內(nèi)地球化學(xué)分析項目，直至聽取研究生對獲得的*手資料總結(jié)和分析，鄭永飛都是全程參與，有意識地引導(dǎo)和鼓勵他們建立起判斷問題、發(fā)現(xiàn)問題、解決問題的能力，訓(xùn)練他們從事科學(xué)研究的“基本功”。
　　徐寶龍是鄭永飛回國后培養(yǎng)的*個碩士研究生，他的學(xué)位*文成果發(fā)表在**地球化學(xué)刊物《地球化學(xué)與宇宙化學(xué)》上，現(xiàn)在該生已經(jīng)畢業(yè)十余年了，也已出了自己的事業(yè)，而該生的*文卻是鄭永飛教授在大年初一修改出來的。
　　“那是1998年大年初一，家里還沒有通暖氣，人感到特別的冷，在家總看電視又覺得沒多大意思，于是翻開了學(xué)生剛寫的英文*文，逐字逐句地修改起來�！编嵱里w回憶說。
　　“鄭老師治學(xué)態(tài)度嚴(yán)謹(jǐn)，對學(xué)生要求非常嚴(yán)格。對我們寫的*文，他總是逐字逐句地修改，不放過任何一個不妥之處，哪怕只是個小小的標(biāo)點(diǎn)符號。”前不久，剛剛在**學(xué)*刊物《化學(xué)地質(zhì)學(xué)》上發(fā)表*文的女博士生趙彥彥告訴記者。對每個學(xué)生的投稿*文，鄭老師都要反復(fù)推敲，前后修改幾十遍。
　　為拓展學(xué)生的*化視野，盡快將學(xué)生帶到科技*前沿，鄭永飛每年都要選派2～3名博士生和青年教師參加*地球化學(xué)年會，并提供經(jīng)費(fèi)資助。在他的實驗室，幾乎每個研究生都參加過*外學(xué)*會議并頭報告或壁報展講，在*外學(xué)*刊物上發(fā)表過研究成果。
　　“只有我們知道別人了什么，才能知道怎樣把自己的事情得更好�！边@是鄭永飛經(jīng)常掛在嘴邊的話，也是用來激勵學(xué)生的話語。
　　“每次參加會議前，至少要在實驗室試講一遍，達(dá)到*效果才能放行�！编嵱里w的博士生、現(xiàn)在留校任教的趙子福教授介紹說。每次鄭老師都要大家好PPT文件，精心準(zhǔn)備自己的匯報材料，目的是要在有限時間內(nèi)表達(dá)清楚自己的成果，充分展示自己所工作的要點(diǎn)。
　　“與大師親密接觸，與同行互通有無，能充分接觸到*外*先進(jìn)的科技信息，把握世界科學(xué)前沿。”張少兵在鄭永飛的指導(dǎo)下，以*作者身份先后在*外學(xué)*刊物上發(fā)表了7篇*文，成為固體地球科學(xué)領(lǐng)域**的博士畢業(yè)生之一。如今，他正在從事博士后研究工作，自主申請的國家自然科學(xué)青年基金項目已經(jīng)獲得資助。
　　與此同時，鄭永飛還鼓勵學(xué)生出國參與合作研究，為研究生提供更多的*交*機(jī)會。2009年6月底，鄭永飛選派博士研究生陳伊翔去日本岡山大學(xué)參加一個實習(xí)項目，在岡山大學(xué)教授的指導(dǎo)下，陳伊翔主要研究榴輝巖的同位素年代學(xué)，為期一個半月。