蔡元培：從北京大學(xué)校長(zhǎng)到監(jiān)察院長(zhǎng)
　　蔡元培為清末翰林，后倡言革命，創(chuàng)立光復(fù)會(huì)。民國(guó)初造，他出任教育總長(zhǎng)，后因不滿袁世凱獨(dú)裁而離職赴法留學(xué)。“二次革命”期間回國(guó)協(xié)助孫中山，失敗后再次赴法國(guó)留學(xué)。
　　1868年1月11日，蔡元培生于人杰地靈的浙江紹興。蔡元培乳名阿培，入塾后，取名元培。原字鶴卿，后改字仲申，曾化名蔡振、周子余。創(chuàng)辦愛國(guó)學(xué)社時(shí)，自號(hào)民友。任《警鐘日?qǐng)?bào)》主編時(shí)，自謂“吾亦一民耳，何謂民友？”于是取《詩(shī)經(jīng)?大雅》中“周余黎民，靡有孑遺”兩句中各一字，改號(hào)孑民，以后便一直沿用。
　　蔡元培家世代經(jīng)商，祖父曾任當(dāng)鋪經(jīng)理，父親當(dāng)過錢莊經(jīng)理。蔡元培弟兄三人中，屬他最聰穎好學(xué)，父親對(duì)他著意培養(yǎng)，延聘塾師來家中課讀。他11歲時(shí)父親去世，家道中落。母親周氏，克勤克儉，典賣首飾，撫養(yǎng)稚子成人，并經(jīng)常以“自立”和“不依賴”勉勵(lì)他們。父母的言行，對(duì)蔡元培的性格有很大影響。他一生勤奮，為人寬厚和不茍取，就是從小在這樣的家庭環(huán)境的潛移默化下養(yǎng)成的。父親去世后請(qǐng)不起家庭教師，他便到別處附讀。由于家貧不能經(jīng)常點(diǎn)燈，他便借爐灶火光映照夜讀。有一次，他在樓上讀書，宅中起火，舉家驚慌，疾呼他下樓，他因全神貫注于書本，竟然毫不察覺。
　　5歲時(shí)，蔡元培入私塾讀書，為了應(yīng)科舉考試，他從12歲開始習(xí)作八股文。因他在寫文章時(shí)常用古書中的通假字換常字，用古書中奇特的句法換常調(diào)，被人笑稱“怪八股”。17歲時(shí)，參加小考，文章“筆輕而靈，意曲而達(dá)”，“論尤警當(dāng)，與眾不同，詩(shī)亦有動(dòng)日句”，“簡(jiǎn)潔名貴，滴滴歸原”，考中秀才。蔡元培從此結(jié)束了私塾學(xué)習(xí)生涯，在家鄉(xiāng)設(shè)館教書，當(dāng)起了塾師。兩年之后，蔡元培到同鄉(xiāng)徐樹蘭家當(dāng)陪讀，并幫助�？彼�刻藏書。四年里，蔡元培翻閱了徐家十余萬卷藏書，博覽群書，學(xué)識(shí)大長(zhǎng)。
　　1889年秋，蔡元培赴杭州參加鄉(xiāng)試，得中舉人，同科舉人有徐維則、王佐、童學(xué)琦、汪大燮、汪康年等。第二年春，蔡元培和徐維則一道北上京城，參加為光緒皇帝親政所舉行的恩科會(huì)試。蔡元培榜上有名，在本科錄取的327名貢士中名列第80位。會(huì)試中被錄取貢士后，還需經(jīng)殿試合格，方可稱進(jìn)士出身�！耙虻钤嚦�考的名次均以字為標(biāo)準(zhǔn)，我自量寫得不好”，蔡元培未參加本科殿試。三年后，蔡元培補(bǔ)行殿試，被錄取為第二甲第34名進(jìn)士。之后，在朝考中列名第一等，被點(diǎn)為翰林院庶吉士。1894年，蔡元培通過散官考試，升格為翰林院編修。年僅27歲的蔡元培，已是一名才華橫溢，“聲聞當(dāng)代，朝野爭(zhēng)相結(jié)納”的士大夫了。翰林院編修是個(gè)閑職，蔡元培沒有多少事可做，每日足不出戶，鉆研古文詩(shī)詞，“都無做官意，唯有讀書聲”。
　　年輕的蔡元培在科舉仕途上一帆風(fēng)順、平步青云之時(shí)，清王朝卻由于外國(guó)侵略者的一再打擊和它自身的腐朽，正處于風(fēng)雨飄搖、日趨沒落中。甲午戰(zhàn)敗，《中日馬關(guān)條約》簽訂，國(guó)勢(shì)衰微，維新運(yùn)動(dòng)隨之興起。蔡元培在嚴(yán)重的民族危機(jī)面前，幡然覺醒，擺脫仕途，開始涉獵“新學(xué)”，思想為之一變，走向革命。戊戌變法失敗后，蔡元培“知清廷之不足為，革命之不可已，乃浩然棄官歸里，主持教育以啟發(fā)民智”。1898年9月，蔡元培攜眷回到紹興老家。
　　歸鄉(xiāng)后，蔡元培先后被聘為紹興中西學(xué)堂監(jiān)督、嵊縣剡山書院院長(zhǎng)。這是蔡元培教育救國(guó)思想的萌芽，也是他委身教育服務(wù)于新式學(xué)校的開始。蔡元培熱心家鄉(xiāng)的教育事業(yè)，實(shí)地考察之后，寫成《浙江籌辦學(xué)堂節(jié)略》，主張?jiān)谑〕呛贾菰O(shè)一高等師范學(xué)堂、一高等學(xué)堂、一中學(xué)堂，以及若干小學(xué)堂和蒙學(xué)堂，在縣城各設(shè)一小學(xué)堂和若干蒙學(xué)堂，在各鄉(xiāng)設(shè)若干蒙學(xué)堂。
　　1901年8月，蔡元培應(yīng)聘為上海南洋公學(xué)特班教授。南洋公學(xué)是盛宣懷創(chuàng)辦的一所訓(xùn)練洋務(wù)人才的學(xué)校，是今天上海交通大學(xué)的前身。特班于1901年增設(shè)，是培養(yǎng)高材生的，其章程第一條規(guī)定：“特設(shè)一班以待成材之有志西學(xué)者�！痹谀涎蠊珜W(xué)，蔡元培培養(yǎng)的學(xué)生中有黃炎培、邵力子、洪允祥、李叔同等40余位名人。
　　在教學(xué)的同時(shí)，蔡元培開始涉足報(bào)界和出版界。10月，他與好友張?jiān)獫?jì)合議創(chuàng)辦《開先報(bào)》（后改名為《外交報(bào)》）。同時(shí)，他選錄梁?jiǎn)⒊�、�?yán)復(fù)等名士著譯文章42篇，編輯為《文變》一書。蔡元培還兼任商務(wù)印書館編譯所所長(zhǎng)，負(fù)責(zé)制定國(guó)文、歷史、地理三科教科書的編纂體例。
　　1902年4月，蔡元培和葉瀚、蔣觀云等上海教育界人士發(fā)起成立了中國(guó)教育會(huì)，蔡為會(huì)長(zhǎng)。中國(guó)教育會(huì)以教育中國(guó)男女青年，開發(fā)其智識(shí)，而增進(jìn)其國(guó)家觀念，以為他日恢復(fù)國(guó)權(quán)之基礎(chǔ)為目的，“表面辦理教育，暗中鼓吹革命”，是20世紀(jì)初年國(guó)內(nèi)最早的革命團(tuán)體。教育會(huì)成立不久，即創(chuàng)辦了一所愛國(guó)女校。隨后為了接納南洋公學(xué)學(xué)潮中的退學(xué)學(xué)生，蔡元培又創(chuàng)辦了愛國(guó)學(xué)社，并被推選為學(xué)社總理。
　　愛國(guó)女校和愛國(guó)學(xué)社以倡言革命為己任，是革命黨人活動(dòng)的重要場(chǎng)所。蔡元培還和吳稚暉、章太炎等在《蘇報(bào)》上連續(xù)發(fā)表鼓吹反清革命的評(píng)論文章，“崇論橫議，震撼一世”。
　　1903年4月，拒俄運(yùn)動(dòng)興起，中國(guó)教育會(huì)與東京留日學(xué)界緊密呼應(yīng)，在上海開展了拒法、拒俄運(yùn)動(dòng)，蔡元培是這一運(yùn)動(dòng)的主要領(lǐng)導(dǎo)者之一。他還創(chuàng)辦了刊物《俄事警聞》（后改為《警鐘日?qǐng)?bào)》），專門登載俄兵侵犯滿洲的消息，并抨擊清政府外交的失敗，以通過反帝愛國(guó)的宣傳，激發(fā)人們的反清革命意志。
　　中國(guó)教育會(huì)在張園舉行演說會(huì)，1200多人參加了集會(huì)。蔡元培首先作了慷慨激昂的演講，接著宣讀東京留日學(xué)生的來電，當(dāng)他讀到“俄禍日急，留日學(xué)生已電北洋主戰(zhàn)，結(jié)義勇隊(duì)赴敵，望協(xié)助”時(shí)，全體與會(huì)者列隊(duì)向東行一鞠躬，以表示對(duì)留日學(xué)生的支持和敬意。上�！蹲至治鲌�(bào)》對(duì)此稱贊說：“夫中國(guó)立國(guó)以來二千余年，其人民有愛國(guó)心者，自此次會(huì)議開始�！睍�(huì)后，蔡元培以愛國(guó)學(xué)社學(xué)生為基礎(chǔ)組成義勇隊(duì)，進(jìn)行軍事訓(xùn)練。他本人也剪短頭發(fā)，身穿制服，與師生同受軍訓(xùn)。
　　張園集會(huì)引起清政府的嫉恨，要求江蘇巡撫“即將為首之人密拿嚴(yán)辦”。蔡元培身處險(xiǎn)境，臨危不懼，仍熱心愛國(guó)學(xué)社工作。這時(shí)，愛國(guó)學(xué)社學(xué)生發(fā)生內(nèi)訌，蔡元培痛心疾首，憤然辭職離開上海前往青島。十余天后，《蘇報(bào)》案發(fā)，章太炎、鄒容被捕入獄，蔡元培因遠(yuǎn)在青島而幸免。
　　蔡元培認(rèn)為革命只有兩途，一是暴動(dòng)，一是暗殺。受俄國(guó)民粹派的影響，他思想上傾向于暗殺�！短K報(bào)》案風(fēng)波過后，蔡元培回到上海，繼續(xù)從事革命活動(dòng)，并加入暗殺團(tuán)。當(dāng)時(shí)，因武裝起義計(jì)劃泄露，黃興等華興會(huì)會(huì)員避難上海。蔡元培參與了華興會(huì)在上海的活動(dòng)，深受啟發(fā)，決定仿照華興會(huì)成立光復(fù)會(huì)。蔡元培和獄中的章太炎詳細(xì)籌劃，經(jīng)各方努力，光復(fù)會(huì)很快成立，蔡元培被推為會(huì)長(zhǎng)。光復(fù)會(huì)以“光復(fù)漢族，還我山河，以身許國(guó)，功成身退”為宗旨。光復(fù)會(huì)發(fā)展很快，徐錫麟、陶成章、柳亞子、黃炎培、劉師培、秋瑾、孫毓筠等都是光復(fù)會(huì)會(huì)員。蔡元培逐漸成為東南地區(qū)革命活動(dòng)的核心人物。同盟會(huì)成立后，光復(fù)會(huì)納入同盟會(huì)的領(lǐng)導(dǎo)之下，蔡元培任同盟會(huì)上海分會(huì)會(huì)長(zhǎng)。
　　1906年夏，清政府?dāng)M派翰林院編檢出國(guó)。蔡元培一直希望能到歐洲國(guó)家學(xué)習(xí)，得此消息，便將同盟會(huì)上海分會(huì)會(huì)長(zhǎng)一職委托黃炎培代理，于8月底只身一人來到北京等候派遣。就在蔡元培準(zhǔn)備赴歐之際，清廷卻因經(jīng)費(fèi)短缺，決定改派日本。蔡元培不愿去日本，決意赴德游學(xué)，只好暫時(shí)留京，從長(zhǎng)計(jì)議。天賜良機(jī)，次年春，蔡元培故交孫寶瑄之兄孫寶琦出任駐德公使，孫寶琦答應(yīng)接納他為駐德公使職員，并允以每月資助學(xué)費(fèi)30兩。7月初，蔡元培隨孫寶琦一行來到柏林，半工半讀由此開始了他為期四年多的留學(xué)生活。
　　蔡元培在柏林生活一年之后，遷居萊比錫，進(jìn)入萊比錫大學(xué)主修哲學(xué)。蔡元培在異國(guó)他鄉(xiāng)如饑似渴地學(xué)習(xí)新知識(shí)，從哲學(xué)到文學(xué)，從心理學(xué)到美學(xué)，從民族學(xué)到比較文明史，從美術(shù)史到自然科學(xué)發(fā)展史，幾乎涵蓋了所有的人文學(xué)科。1909年，蔡元培破例進(jìn)入萊比錫大學(xué)文明史和世界史研究所學(xué)習(xí)。
　　留學(xué)期間，蔡元培依據(jù)西洋學(xué)術(shù)史的原則，在日本學(xué)者研究東洋倫理學(xué)史的基礎(chǔ)上，系統(tǒng)整理了我國(guó)傳統(tǒng)的倫理學(xué)說，寫成《中國(guó)倫理學(xué)史》。全書將中國(guó)倫理學(xué)史的發(fā)展分為“先秦創(chuàng)始時(shí)代”、“漢唐繼承時(shí)代”和“宋明理學(xué)時(shí)代”。蔡元培認(rèn)為，我國(guó)四千年來的倫理學(xué)說，先秦最盛，倫理學(xué)說是儒、道、農(nóng)、墨、法、名各家的重要組成部分。漢代以后，儒、道、釋三教并存，儒教始終是倫理學(xué)的正宗。自漢而唐，倫理學(xué)方面成一家之言者屈指可數(shù)。宋、明兩代，朱熹、陸九淵兩派一直是倫理學(xué)的主流。此外，蔡元培還翻譯了康德派哲學(xué)家包爾生的著作《倫理學(xué)原理》。該書由商務(wù)印書館出版后，引起國(guó)內(nèi)學(xué)者的關(guān)注，被一些學(xué)校采用為倫理學(xué)教科書。
　　蔡元培在研究倫理學(xué)的同時(shí)，對(duì)國(guó)學(xué)中素不重視的“美學(xué)”也產(chǎn)生了極大興趣�！懊烙�者，孑民在德國(guó)受有極深之印象，而愿出全力以提倡之者也”�！懊烙�”一詞，即是蔡元培從德文Asthetische Erziehung譯得。蔡元培畢生都不遺余力地提倡美育，強(qiáng)調(diào)美育是養(yǎng)成健全人格所不可缺少的因素�！爸袊�(guó)之有美學(xué)，實(shí)以蔡元培先生提倡為最早”，“以美育代宗教”是蔡元培美育思想中的一個(gè)重要理論。
　　辛亥革命爆發(fā)后，蔡元培于1911年12月結(jié)束其在德國(guó)的工讀生活回到上海。中華民國(guó)臨時(shí)政府成立后，蔡元培出任教育總長(zhǎng)。民國(guó)初建，百?gòu)U待興。1912年初，蔡元培主持教育部先后頒布了《普通教育暫行辦法》、《普通教育暫行課程標(biāo)準(zhǔn)》、《民國(guó)教育部官職令》以及一些教育法令，改革清末舊學(xué)制，以確保近代教育思想和方針的實(shí)施，其主要內(nèi)容有：小學(xué)廢止讀經(jīng)；廢禁清廷頒布的教科書，各科教科書必須符合共和國(guó)國(guó)民宗旨；稱呼上改學(xué)堂為學(xué)校；初等小學(xué)男女不分校；廢止獎(jiǎng)勵(lì)出身的舊制等。蔡元培極為提倡社會(huì)教育，致力于普及教育、有教無類，他在教育部?jī)?nèi)設(shè)有社會(huì)教育司，由教育部通令各省推行社會(huì)教育，使社會(huì)教育首次在教育行政上獲得了獨(dú)立地位。
　　南北議和告成，蔡元培受命率領(lǐng)迎袁專使團(tuán)，北上迎袁南下就任民國(guó)臨時(shí)大總統(tǒng)。袁世凱不肯南下，大耍兩面派伎倆，使得蔡元培對(duì)其一手導(dǎo)演的京、津、保地區(qū)“兵變”信以為真，最終袁世凱在北京宣布就職。袁世凱上臺(tái)后，蔡元培在唐紹儀內(nèi)閣中繼續(xù)擔(dān)任教育總長(zhǎng)。
　　1912年2月，蔡元培就任教育總長(zhǎng)期間寫過《對(duì)于新教育之意見》一文，提出軍國(guó)民教育、實(shí)利主義教育、公民道德教育、世界觀教育及美感教育五項(xiàng)為今后的教育方針。該文否定了前清教育宗旨中“忠君”、“尊孔”最重要的兩條，指出“忠君與共和政體不合，尊孔與信教自由相違”，從而打破了兩千年來中國(guó)傳統(tǒng)的封建教育兩條不可動(dòng)搖的信條。除了“破”的功勞外，該文還有“立”的意義，蔡元培首倡德、智、體、美四育，從而為民主共和教育奠定了第一塊基石。《對(duì)于新教育之意見》一文實(shí)際上承擔(dān)了中國(guó)新興資產(chǎn)階級(jí)在教育方面的綱領(lǐng)性作用，體現(xiàn)出辛亥革命的偉大成果和民主共和精神。該文不僅具有反封建的進(jìn)步意義，對(duì)民國(guó)以后教育的影響也很大。
　　針對(duì)傳統(tǒng)封建專制影響下的一些軍政人員私德不夠、缺乏民主共和思想素養(yǎng)的社會(huì)現(xiàn)象，蔡元培等在上海發(fā)起成立“進(jìn)德會(huì)”。隨后他又和宋教仁等發(fā)起組織“社會(huì)改良會(huì)”，闡明宗旨在以人道主義及科學(xué)知識(shí)為標(biāo)準(zhǔn)而定改良社會(huì)之條件，列舉改革社會(huì)上種種惡習(xí)，提出不狎妓、不置婢妾、不賭博、破除迷信、為官不受饋贈(zèng)等共36條，以圖通過這一組織的提倡，為新的民主共和社會(huì)樹立新風(fēng)。
　　在蔡元培及同仁的竭誠(chéng)努力下，全國(guó)臨時(shí)教育會(huì)議于1912年7月10日在北京正式開幕。這次會(huì)議歷時(shí)一個(gè)月，通過了23項(xiàng)提案，在我國(guó)近代教育史上具有劃時(shí)代的意義。它開創(chuàng)了中國(guó)近代教育的先河，新的教育制度在我國(guó)以法律的形式開始確定下來，奠定了中國(guó)近代教育體制的基礎(chǔ)，是對(duì)清朝教育制度的一次徹底否定。
　　因不滿袁氏獨(dú)裁專政，蔡元培在全國(guó)臨時(shí)教育會(huì)議期間，辭去教育總長(zhǎng)職務(wù)。蔡元培卸職后，攜眷赴萊比錫大學(xué)文明史和世界史研究所從事研究工作。宋教仁案發(fā)生后，蔡元培接到孫中山的電召，邀他回國(guó)共商討袁對(duì)策，便迅速返國(guó)參加二次革命。蔡元培雖然主張反袁，但在方法上卻不贊成孫中山提出的武力討袁之法，而想通過和平調(diào)解來解決南北方的沖突。后調(diào)停不成，他又寫了一系列文章抨擊袁世凱專制。二次革命失敗后，蔡元培無法繼續(xù)留在國(guó)內(nèi)，只好游學(xué)法國(guó)。前后兩次西方留學(xué)的經(jīng)歷使得他主張向西方學(xué)習(xí)，反對(duì)閉關(guān)自守。
　　旅法期間，蔡元培學(xué)習(xí)之余，協(xié)助李石曾、汪精衛(wèi)、吳稚暉和吳玉章等人辦理留法儉學(xué)會(huì)，幫助留法青年。1916年3月，中法兩國(guó)合辦的華法教育會(huì)在巴黎成立，蔡元培任中方會(huì)長(zhǎng)，并在該會(huì)開辦的華工學(xué)校親自授課，并前后為華工學(xué)校編了德育、智育講義40篇左右，講義內(nèi)容多含哲理和積極的辯證法因素，具有啟迪民智的作用。
　　蔡元培是旅法學(xué)界的一面旗幟，華法教育會(huì)的創(chuàng)立既為中國(guó)有志青年提供了留法勤工儉學(xué)的機(jī)會(huì)，更促進(jìn)了法國(guó)文化科學(xué)在中國(guó)的傳播。留法勤工儉學(xué)，在中國(guó)近代教育史和留學(xué)史上是前無古人后無來者的創(chuàng)舉，也是國(guó)人向西方學(xué)習(xí)的十分有益的新形式。這種形式在五四前后獲得了較大發(fā)展，為國(guó)內(nèi)許多無力出國(guó)求學(xué)的青年提供了半工半讀留學(xué)法國(guó)的機(jī)會(huì)，也促成了中西文化的進(jìn)一步碰撞與交融。
　　1916年，蔡元培任北京大學(xué)校長(zhǎng)，倡導(dǎo)“思想自由，兼容并包”的辦學(xué)方針，進(jìn)行了大刀闊斧的改革。他廣攬人才，設(shè)立了研究所，開近代中國(guó)大學(xué)之先河，使北京大學(xué)成為中國(guó)的名校。
　　1916年9月初，蔡元培收到教育部總長(zhǎng)范源濂來電，電云：“國(guó)事漸平，教育宜急。現(xiàn)在首都最高學(xué)府，尤賴大賢主宰，師表群倫。海內(nèi)人士，咸深景仰，用特專電敦請(qǐng)我公擔(dān)北京大學(xué)校長(zhǎng)一席，務(wù)祈鑒允，早日歸國(guó)，以慰瞻望。啟行在即，先祈電告�！辈淘�培接電報(bào)后，心情難以平靜，當(dāng)即決定歸國(guó)就職。
　　12月26日，北洋政府正式任命蔡元培為北京大學(xué)校長(zhǎng)。1917年元月，北大舉行開學(xué)典禮，蔡元培發(fā)表著名的《就任北京大學(xué)校長(zhǎng)之演說》。北京大學(xué)的前身是京師大學(xué)堂，這個(gè)全國(guó)最高學(xué)府的官僚腐敗習(xí)氣是出了名的，蔡元培在開學(xué)典禮上與北大學(xué)生約法三章：一是抱定宗旨，二是砥礪德行，三是敬愛師友。他教導(dǎo)北大學(xué)子，要“以研究學(xué)術(shù)為天職，不當(dāng)以大學(xué)為升官發(fā)財(cái)之階梯”，“抱定宗旨”是要“為求學(xué)而來”，“宗旨既定，自趨正軌”。蔡元培的到來，給暮氣沉沉的北京大學(xué)帶來新的氣息。
　　當(dāng)時(shí)，北京大學(xué)“像個(gè)衙門，沒有多少學(xué)術(shù)氣氛。有的教師不學(xué)無術(shù)，一心只想當(dāng)官；有的教師本身就是北洋政府的官僚，學(xué)問不大，架子不��；有的教師死守本分，不允許有新思想”。學(xué)生則大多是官僚和富人子弟。蔡元培根據(jù)多年辦學(xué)經(jīng)驗(yàn)，認(rèn)為“大約大學(xué)之所以不滿人意者，一在學(xué)課之凌雜，二在風(fēng)紀(jì)之?dāng)�壞。救第一弊，在延聘純粹之學(xué)問家，一面教授，一面與學(xué)生共同研究，以改造大學(xué)為純粹研究學(xué)問之機(jī)關(guān)。救第二弊，在延聘學(xué)生之模范人物，以整飭學(xué)風(fēng)”。上任伊始，蔡元培開始了大刀闊斧的改革。
　　蔡元培破“年齡”和“資格”限制，廣攬人才。文科方面，聘請(qǐng)陳獨(dú)秀為文科學(xué)長(zhǎng)，錢玄同為教授兼國(guó)文門研究所教員，劉半農(nóng)為預(yù)科國(guó)文教授兼國(guó)文門研究所教員，周作人為教授兼國(guó)史編纂處編纂員，胡適為文科教授兼哲學(xué)研究所主任，李大釗為圖書館主任，兼任經(jīng)濟(jì)、史學(xué)等系的教授。他力排眾議，聘請(qǐng)梁漱溟到北大講授印度哲學(xué)。理科方面，蔡元培聘用國(guó)內(nèi)第一個(gè)介紹愛因斯坦相對(duì)論的物理學(xué)家夏元瑮為理科學(xué)長(zhǎng)，另陸續(xù)聘請(qǐng)李四光、丁文江、朱家驊等知名學(xué)者任教。法科方面，蔡元培留任司法部的王寵惠和羅文干為講師，解聘了不稱職的教員，并規(guī)定專任教員不得在他校兼課，政府官員不得為專任教員。北京大學(xué)名家云集，可謂群星閃爍。
　　北洋政府任命書
　　在“兼容并包”、“思想自由”八字方針指導(dǎo)下，蔡元培極力打造北大為“囊括大典，網(wǎng)羅眾家”的學(xué)府，使各派思想并存北大，百家爭(zhēng)鳴，爭(zhēng)奇斗妍，討論、研究之風(fēng)盛極一時(shí)。他認(rèn)為墨守成規(guī)，守一家之言，思想一元獨(dú)裁，是不可能使學(xué)術(shù)得到真正發(fā)展的。他還認(rèn)為學(xué)術(shù)上派別林立是相對(duì)的，各學(xué)科教員即使主張不同，只要言之成理，持之有故，就應(yīng)該并存，讓學(xué)生在思想的百家爭(zhēng)鳴中自由選擇。正是在蔡元培的鼓勵(lì)下，在北大“為學(xué)問而學(xué)問的精神蓬勃一時(shí)。保守派、維新派和激進(jìn)派都同樣有機(jī)會(huì)爭(zhēng)一日之短長(zhǎng)。背后托著長(zhǎng)辮，心理眷戀帝制的老先生與思想激進(jìn)的新人物并坐討論，同席笑謔。教室里、座談會(huì)上、社交場(chǎng)合里，到處討論著知識(shí)、文化、家庭、社會(huì)關(guān)系和政治制度等等問題。這情形很像中國(guó)先秦時(shí)代，或者古希臘蘇格拉底和亞里斯多德時(shí)代的重演”。此外，蔡元培熱心延請(qǐng)中外著名學(xué)者來校講演。梁?jiǎn)⒊�、章太炎、杜威、羅素、泰戈?duì)柕榷荚�到北大講演，北大成為名副其實(shí)的全國(guó)最高學(xué)府。隨著陳獨(dú)秀、胡適、魯迅等新文化運(yùn)動(dòng)的猛將的到來，北大成為新文化運(yùn)動(dòng)的主要陣地。特別值得一提的是，北大教員中除了提倡新文化運(yùn)動(dòng)的進(jìn)步人士，還有許多思想保守卻學(xué)術(shù)造詣?lì)H深的著名學(xué)者，比如辜鴻銘、劉師培、黃侃、崔適等。
　　在蔡元培力倡下，1917年底，北大文、理、法三科各學(xué)門先后分別成立了研究所。文科研究所分哲學(xué)門、國(guó)文門和英文門，由胡適、沈尹默、黃振聲任主任；理科研究所分?jǐn)?shù)學(xué)門、物理門和化學(xué)門，由秦汾、張大椿、俞同奎任主任；法科研究所由法律門、政治門、經(jīng)濟(jì)門組成，依次由黃右昌、陳啟修、馬寅初負(fù)責(zé)。后來于1919年12月又增設(shè)地質(zhì)學(xué)研究所，何杰任主任。北大研究所的創(chuàng)立，開國(guó)內(nèi)大學(xué)設(shè)立研究所之先河，具有開創(chuàng)性意義。
　　蔡元培積極引導(dǎo)北大學(xué)生創(chuàng)造進(jìn)取活潑的精神生活，支持全校師生創(chuàng)辦刊物，組織各類學(xué)術(shù)研究團(tuán)體。一時(shí)之間，各類團(tuán)體如雨后春筍般出現(xiàn)在北大校園，“學(xué)生們打麻將、吃花酒的越來越少，研究學(xué)問和關(guān)心國(guó)家前途命運(yùn)的越來越多”。到1919年初，北大已有各種團(tuán)體20多個(gè)，打破了改革前沉悶、頹廢、腐朽的局面，學(xué)術(shù)討論和思想爭(zhēng)辯蔚為風(fēng)氣，學(xué)校出現(xiàn)了生機(jī)勃勃的景象。
　　在管理方面，蔡元培仿效德國(guó)大學(xué)制度，改校長(zhǎng)大權(quán)獨(dú)攬為民主辦校，設(shè)立評(píng)議會(huì)，實(shí)行教授治校。評(píng)議會(huì)是全校的最高立法機(jī)構(gòu)和權(quán)力機(jī)構(gòu)，評(píng)議員除校長(zhǎng)外，包括各科學(xué)長(zhǎng)和主任教員，各本科、預(yù)科教授二人，由教授自行互選，任期一年。1919年后，評(píng)議員的產(chǎn)生按名額分配，每5名教授選舉產(chǎn)生1名評(píng)議員。
　　為擴(kuò)大教授治校的范圍，1917年12月，蔡元培主持召開評(píng)議會(huì)會(huì)議，決定設(shè)立各學(xué)科教授會(huì)，教授會(huì)會(huì)員由各科的教授和講師組成，教授會(huì)主任由會(huì)員選舉產(chǎn)生，任期兩年。1919年，采用分系制后，改由各系成立教授會(huì)，各系主任由教授會(huì)投票選舉。由此加強(qiáng)了各學(xué)科專家學(xué)者的責(zé)任心，調(diào)動(dòng)了他們的積極性，提高了行政效率和教學(xué)質(zhì)量，從而促進(jìn)了學(xué)校的蓬勃發(fā)展。
　　1919年4月，各科教授主任組成全校統(tǒng)一的教務(wù)處，負(fù)責(zé)領(lǐng)導(dǎo)全校的教學(xué)工作，文、理、法各科學(xué)長(zhǎng)制從此廢止。教務(wù)處設(shè)教務(wù)長(zhǎng)，教務(wù)長(zhǎng)從各系教授會(huì)主任中推選，任期一年。9月，設(shè)立行政會(huì)議，作為全校最高行政機(jī)構(gòu)和執(zhí)行機(jī)關(guān)，負(fù)責(zé)實(shí)施評(píng)議會(huì)的各項(xiàng)決議。蔡元培建立的這套“教授治�！鳖I(lǐng)導(dǎo)體制，最大限度地排除了外界對(duì)教學(xué)工作的影響，保證了正常的教學(xué)工作。
　　蔡元培堅(jiān)持平民教育、擇優(yōu)錄取的招生原則，使許多出身貧寒、學(xué)業(yè)優(yōu)秀的青年學(xué)子進(jìn)入了北京大學(xué)。蔡元培還主張開門辦學(xué)，學(xué)校的學(xué)術(shù)活動(dòng)和課堂的教學(xué)活動(dòng)，都可以向社會(huì)公開，每年招收一定數(shù)量的旁聽生、選科生。蔡元培打破陳規(guī)，正式招收女生入學(xué)，開我國(guó)大學(xué)男女同校之先河。
　　在學(xué)制和體制方面，蔡元培也進(jìn)行了大刀闊斧的改革。在學(xué)制改革方面，首先，擴(kuò)大了文理兩科，增設(shè)史學(xué)門和地質(zhì)學(xué)門；法科獨(dú)立，商科則并入法科；工科與北洋大學(xué)合并，預(yù)科改屬本科。其次，撤銷文理科界限，將各科所屬的專業(yè)一律改稱為系，學(xué)長(zhǎng)制也因此廢除。另外，改年級(jí)制為選科制。大學(xué)本科應(yīng)學(xué)滿80學(xué)分，必修、選修各占一半，可提前修滿畢業(yè)。
　　五四運(yùn)動(dòng)爆發(fā)后，蔡元培支持學(xué)生運(yùn)動(dòng)，甚至以辭職相抗，從而有了北大師生的“挽蔡護(hù)�！边\(yùn)動(dòng)，并最終取得了勝利。后來，他又先后參與發(fā)起“好人政府”、“聯(lián)省自治”運(yùn)動(dòng)，均無果而終。
　　1919年5月1日，巴黎和會(huì)上中國(guó)外交失敗的消息傳到北京，人們震驚不已，尤其是思想敏銳、血?dú)夥絼偟那嗄陮W(xué)生更情緒激昂。1919年5月4日，北大學(xué)生領(lǐng)頭，各校學(xué)生3000余人齊集天安門開大會(huì)并列隊(duì)游行，趙家樓被燒，章宗祥被打，五四運(yùn)動(dòng)爆發(fā)，當(dāng)局當(dāng)場(chǎng)逮捕學(xué)生32人，其中北大學(xué)生20人。當(dāng)日，教育部發(fā)出訓(xùn)令給蔡元培等，訓(xùn)令說：“本部為維持秩序，嚴(yán)整學(xué)風(fēng)起見，用特切實(shí)通令各校對(duì)于學(xué)生當(dāng)嚴(yán)盡管理之責(zé)，其有不遵約束者，應(yīng)立即予開除，不得姑寬。以敦士習(xí)，而重校規(guī)�！贝稳粘�，又明令各校校長(zhǎng)將為首滋事學(xué)生一律開除。蔡元培對(duì)于學(xué)生的愛國(guó)行動(dòng)是支持的，他拒絕聽從教育部的命令召回集會(huì)學(xué)生，回答說：“學(xué)生愛國(guó)運(yùn)動(dòng)，我不忍制止�！�
　　5月5日下午2時(shí)，北京市14校校長(zhǎng)在北大開會(huì)，成立了以蔡元培為首的校長(zhǎng)團(tuán)。蔡元培為營(yíng)救被捕學(xué)生日夜奔忙，經(jīng)多方周旋，北洋政府于5月7日釋放了被捕學(xué)生。蔡元培因支持學(xué)生的愛國(guó)運(yùn)動(dòng)，得罪當(dāng)局，北洋政府遂決定由馬其昶接替蔡元培。蔡元培以辭職相抗，于5月8日晚間遞送了辭呈。9日晨，便悄然離京南下。北大師生得知蔡元培辭職的消息后，召開全體教職員會(huì)議，決定推舉8人赴教育部請(qǐng)總長(zhǎng)設(shè)法挽留蔡校長(zhǎng)。
　　10日下午1時(shí)，北大代表馬敘倫、馬寅初、李大釗等赴教育部謁見教育總長(zhǎng)傅增湘，表示：“如不能挽回蔡校長(zhǎng)，亦決定一致總辭職。”這時(shí)，北京各國(guó)立專門學(xué)校校長(zhǎng)也紛紛遞上辭呈，聲援北大師生的“挽蔡”行動(dòng)。當(dāng)日下午5時(shí)半，北京12所大學(xué)的校長(zhǎng)在北大集會(huì)，認(rèn)為“蔡之能挽回與否，非一校長(zhǎng)之去留問題，與教育及外交前途，均有關(guān)系”。與此同時(shí)，北京中等以上學(xué)生聯(lián)合會(huì)也呈文教育部，力請(qǐng)挽留蔡元培校長(zhǎng)。全國(guó)各界紛紛函電教育部支持“挽蔡”運(yùn)動(dòng)，相持?jǐn)?shù)十日之久。徐世昌被迫于5月14日以總統(tǒng)名義簽發(fā)了留蔡指令：“該校長(zhǎng)殫心教育，任職有年。值茲整飭學(xué)風(fēng)，妥籌善后，該校長(zhǎng)職責(zé)所在，亟待認(rèn)真擘理，挽濟(jì)艱難。所請(qǐng)解職之處，著毋庸議�！�9月，新學(xué)期開始，蔡元培返京回校。北大師生的“挽蔡護(hù)�！比〉昧俗詈髣倮�。
　　五四運(yùn)動(dòng)后，北京教育界掀起教育獨(dú)立運(yùn)動(dòng)，反對(duì)軍閥官僚政客對(duì)教育的摧殘。蔡元培從歐洲考察回國(guó)后，撰文《教育獨(dú)立議》，聲援教育獨(dú)立運(yùn)動(dòng)。蔡元培在文章中指出，“教育是幫助被教育的人，給他能發(fā)展自己的能力，完成他的人格，于人類文化上能盡一分子的責(zé)任；不是把被教育的人，造成一種特別器具，給抱有他種目的的人去應(yīng)用的。所以，教育事業(yè)當(dāng)完全交與教育家，保有獨(dú)立的資格，毫不受各派政黨或各派教會(huì)的影響�！�
　　1922年5月14日，由胡適起草，蔡元培領(lǐng)銜，王寵惠、羅文干、湯爾和、陶行知等16人簽名的《我們的政治主張》發(fā)表，提出“好人政府”的口號(hào)。蔡元培、胡適等人希望在吳佩孚的統(tǒng)治下，實(shí)現(xiàn)南北統(tǒng)一。吳佩孚掌權(quán)后，軍閥本性畢現(xiàn)，“好人內(nèi)閣”僅維持了兩個(gè)月就垮臺(tái)了。
　　“好人內(nèi)閣”破產(chǎn)后，張紹曾組閣，彭允彝就任教育總長(zhǎng)。彭允彝“欲見好于一般政客”，“即于同日為干涉司法獨(dú)立與蹂躪人權(quán)之提議，且已正式通過國(guó)務(wù)會(huì)議”，使前財(cái)政總長(zhǎng)羅文干以受賄罪再次被捕入獄。羅文干是北大兼職教員，蔡元培相信他不會(huì)貪污受賄�！霸�培目擊時(shí)艱，痛心于政治清明之無望，不忍為同流合污之茍安；尤不忍于此種教育當(dāng)局之下，支持教育殘局，以招國(guó)人與天良之譴責(zé)。唯有奉身而遠(yuǎn)，以謝教育界及國(guó)人。謹(jǐn)此呈請(qǐng)辭職，迅予派人接替，立卸仔肩�！�1923年1月17日，蔡元培憤然離京南下，蔣夢(mèng)麟代行校長(zhǎng)職務(wù)。
　　7月，蔡元培從上海乘輪船赴歐洲。蔡元培到法國(guó)后，一面從事著譯，一面協(xié)助李石曾辦理華法教育會(huì)及里昂中法大學(xué)的事務(wù)。1924年11月，蔡元培入德國(guó)漢堡大學(xué)，進(jìn)行有關(guān)民族學(xué)的研究工作。在國(guó)民黨一大上，蔡元培被列為候補(bǔ)中央監(jiān)察委員，以后國(guó)民黨各次全國(guó)代表大會(huì)，他均被選為中央監(jiān)察委員。
　　1926年2月，應(yīng)北洋政府教育部電請(qǐng)，蔡元培回國(guó)，他不愿繼續(xù)擔(dān)任北大校長(zhǎng)，因而定居上海�！叭�一八”慘案發(fā)生后，蔡元培更加不愿北上，“今之北京狀況，可以說是較彭允彝時(shí)代又降下幾度”，于是他致電教育部，請(qǐng)辭北大校長(zhǎng)之職。
　　北大教職員聞?dòng)�，致書蔡元培，稱：“本校為先生及同事數(shù)十百人十年來慘淡經(jīng)營(yíng)之學(xué)校，……實(shí)已具有相當(dāng)之規(guī)模。近數(shù)月來，校中同人，不避艱苦與危險(xiǎn)，繼續(xù)在此間奮斗，亦無非欲繼先生之志，為國(guó)家成就一個(gè)真正講學(xué)機(jī)關(guān)。倘斯校境因官僚之壓迫摧殘而遭橫死，先生對(duì)于學(xué)校、對(duì)于在此間繼續(xù)奮斗之同人，其感痛為何如！倘先生之堅(jiān)決言去，實(shí)速其死，先生之感痛更將何如！”情真意切，蔡元培只得暫不提辭職之事，并對(duì)北大評(píng)議會(huì)表示，他“將來必到校一次”。直到1927年張作霖執(zhí)掌北京政府，將北大和其他幾所國(guó)立學(xué)校合并成“京師大學(xué)�！焙�，蔡元培的校長(zhǎng)名義才正式取消。
　　北伐開始后，蔡元培、褚輔成、沈鈞儒、許世英、黃炎培等于11月初發(fā)起組織蘇浙皖三省聯(lián)合會(huì)，主張“聯(lián)省自治”。不久浙江宣布自治，蔡元培被選為省務(wù)委員。此時(shí)，孫傳芳主力雖在江西被消滅，但他仍控制著浙江一帶。12月23日，孫傳芳明令取締蘇浙皖三省聯(lián)合，并通緝蔡元培、褚輔成、許世英等70余人，蔡元培被迫避居象山，后輾轉(zhuǎn)于南方各省宣傳革命。
　　大革命后期，蔡元培追隨蔣介石清黨反共，后成為國(guó)民政府的首任監(jiān)察院長(zhǎng)。后來，他專心學(xué)術(shù)，主持中央研究院�！熬乓话恕笔伦兒�，他倡導(dǎo)民主自由，并任中國(guó)民權(quán)保障同盟副主席，營(yíng)救革命志士。
　　隨著北伐戰(zhàn)爭(zhēng)的節(jié)節(jié)勝利，蔣介石的個(gè)人野心日益膨脹，反共獨(dú)裁傾向日趨明顯。1927年3月16日，蔣介石來到上海，聯(lián)絡(luò)各方，謀劃反共分共運(yùn)動(dòng)。蔡元培應(yīng)蔣介石之邀，于兩日前抵達(dá)上海，頻頻參加各種會(huì)議，成了當(dāng)時(shí)炙手可熱的政治人物。
　　3月28日，蔡元培、吳稚暉、李石曾、古應(yīng)芬等召開國(guó)民黨中央監(jiān)察委員會(huì)常務(wù)會(huì)議，蔡元培任會(huì)議主席。吳稚暉秉蔣介石旨意，提議對(duì)共產(chǎn)黨進(jìn)行彈劾。蔡元培表示同意，主張“取消共產(chǎn)黨人在國(guó)民黨黨籍”，吳稚暉的反共提案獲得通過，將即將掀起的反共惡浪美其名曰“護(hù)黨救國(guó)運(yùn)動(dòng)”。
　　4月2日，蔡元培、吳稚暉、李石曾、張靜江、古應(yīng)芬、陳果夫、李宗仁、黃紹竑等8人，召開所謂中央監(jiān)察委員會(huì)全體會(huì)議（全體監(jiān)察委員共計(jì)20人，僅到8人，未過半數(shù)），蔡元培任主席。會(huì)議通過了吳稚暉提出的彈劾共產(chǎn)黨的文告，要求國(guó)民黨中央執(zhí)行委員會(huì)采取緊急措施，逮捕共產(chǎn)黨員。這次會(huì)議為蔣介石發(fā)動(dòng)反革命政變提供了法律根據(jù)和輿論準(zhǔn)備。
　　4月3日至5日，蔣介石、蔡元培、張靜江、吳稚暉、李石曾、汪精衛(wèi)在上海連續(xù)舉行秘密會(huì)議，策劃反共清黨。
　　4月8日，吳稚暉、何應(yīng)欽等組織的上海臨時(shí)政治委員會(huì)舉行第一次委員會(huì)議，蔡元培為委員之一。該會(huì)規(guī)定：“得以會(huì)議方式?jīng)Q定上海市一切軍事、政治、財(cái)政之權(quán)，并指導(dǎo)當(dāng)?shù)攸h務(wù)”，從而篡奪了中國(guó)共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)上海工人三次武裝起義勝利后建立起來的上海市人民政權(quán)。
　　4月9日，蔡元培、吳稚暉、李石曾等8人以國(guó)民黨中央監(jiān)察委員名義聯(lián)合發(fā)表了“護(hù)黨救國(guó)”通電，公開為蔣介石的“清黨”活動(dòng)張目。
　　4月12日，開始反革命大屠殺，上海市血流成河。
　　4月15日，國(guó)民黨二屆四中全會(huì)在南京召開。當(dāng)時(shí)，國(guó)民黨執(zhí)監(jiān)委共有50余人，而在南京的中央委員僅有蔣介石、蔡元培、張靜江、吳稚暉和李石曾等十余人。由于不夠法定開會(huì)人數(shù)，會(huì)議遂改名為談話會(huì)。此次會(huì)議否認(rèn)了武漢國(guó)民黨中央黨部和武漢國(guó)民政府的合法性，決定在南京重建國(guó)民政府。
　　4月18日，南京國(guó)民政府舉行成立典禮。蔡元培代表國(guó)民黨中央黨部授印，并發(fā)表演說，指責(zé)武漢國(guó)民政府是“受共產(chǎn)黨妨害”和俄國(guó)人操縱的“破壞政府”，要消滅這個(gè)政府。不久，蔡元培被任命為南京國(guó)民政府首任監(jiān)察院院長(zhǎng)。
　　這一時(shí)期，是蔡元培從政生涯的高峰，同時(shí)也是其政治生命中較為晦暗的時(shí)期。
　　書生從政，本色不改。“清黨”運(yùn)動(dòng)后，蔡元培專心教育事業(yè)。4月20日，蔡元培被任命為教育行政委員會(huì)委員，與李石曾、汪精衛(wèi)一起組成教育行政委員會(huì)。
　　在蔡元培、李石曾等人提議下，南京政府改教育部為大學(xué)院，并任命蔡元培為大學(xué)院院長(zhǎng)。大學(xué)院是當(dāng)時(shí)最高學(xué)術(shù)教育機(jī)關(guān)，管理全國(guó)學(xué)術(shù)及教育行政事宜。蔡元培上任后，采取了一系列改革措施。1928年2月21日，蔡元培頒布大學(xué)院通令，廢除全國(guó)春秋祀孔典禮。蔡元培將北京政府時(shí)代分屬于各部院機(jī)關(guān)的中央教育學(xué)術(shù)機(jī)關(guān)并歸大學(xué)院主管，在我國(guó)教育史上第一次將各教育學(xué)術(shù)機(jī)關(guān)統(tǒng)一起來。蔡元培的教育改革設(shè)想很快遇到阻力，8月14日，南京政府在行政院下設(shè)立教育部，實(shí)際上取消了大學(xué)院。
　　與大學(xué)院制相配套的是大學(xué)區(qū)制。蔡元培提議國(guó)民政府仿行法國(guó)實(shí)行大學(xué)區(qū)制，但這項(xiàng)提議從一開始就遭到責(zé)難。1928年6月，張作霖退出北京，國(guó)立京師大學(xué)校隨之解散，大學(xué)院通過了設(shè)立北京大學(xué)區(qū)案。不料北平各校均反對(duì)大學(xué)區(qū)組織，北京大學(xué)學(xué)生最激烈，多次舉行示威游行，反對(duì)大學(xué)區(qū)制。最后，國(guó)民政府做出讓步，北京大學(xué)勝利復(fù)校，至此大學(xué)區(qū)制無法實(shí)行下去。
　　大學(xué)院和大學(xué)區(qū)制的失敗，使蔡元培倍感失望，他決定辭去國(guó)民黨中央政治會(huì)議委員、國(guó)民政府委員、大學(xué)院院長(zhǎng)及兼代司法部長(zhǎng)等本兼各職。國(guó)民政府極力挽留，并先后派宋子文、孔祥熙等政要“躬親敦促”。直到蔡元培第四次遞送辭呈，才照準(zhǔn)。蔡元培逐漸遠(yuǎn)離政治，“愿以余生，專研學(xué)術(shù)”，專心致力于中央研究院的工作。
　　中央研究院于1928年6月9日在上海正式成立，蔡元培任院長(zhǎng)。中央研究院“就名義而言，既為全國(guó)最高學(xué)術(shù)研究機(jī)關(guān)，就職責(zé)言，又兼學(xué)術(shù)之研究、發(fā)表獎(jiǎng)勵(lì)諸務(wù)，實(shí)綜合先進(jìn)國(guó)之中央研究院、國(guó)家學(xué)會(huì)及全國(guó)研究會(huì)議各種意義而成”。中央研究院的成立標(biāo)志著舊中國(guó)科研學(xué)術(shù)的新發(fā)展，極大地促進(jìn)了國(guó)內(nèi)外的學(xué)術(shù)交流。蔡元培雖是研究院的“一把手”，但他堅(jiān)持無為而治的思想，傾聽學(xué)者意見，從不干涉他們的研究工作。同時(shí)，蔡元培盡職盡責(zé)，利用自己的地位和聲望，為研究工作排憂解難。
　　當(dāng)時(shí)，英、法、德、美、日等國(guó)家的學(xué)者，打著“學(xué)術(shù)科研”的幌子，來華進(jìn)行文化侵略。為此，中央研究院規(guī)定：外國(guó)學(xué)者來華考察，不得從事與學(xué)術(shù)無關(guān)的活動(dòng)，所采集的標(biāo)本須留復(fù)本一份于中國(guó)，若無復(fù)本，則應(yīng)將正本留歸中國(guó)。在考察過程中，中央研究院要派員參加。這樣一來，既可以與國(guó)外學(xué)者進(jìn)行合作，又可以達(dá)到維護(hù)文化主權(quán)的目的。
　　“在他（蔡元培）的慘淡經(jīng)營(yíng)下，中研院才能萌芽、茁壯，才能開出美麗的學(xué)術(shù)之花。在民國(guó)十八年（即1929年），中央研究院已有物理、化學(xué)、工程、地質(zhì)、天文、氣象、歷史、語言、心理、社會(huì)科學(xué)等研究所，網(wǎng)羅全國(guó)最優(yōu)異的研究人才，又有自然博物館，在學(xué)術(shù)領(lǐng)域中，分別居于領(lǐng)導(dǎo)的地位。這些成績(jī)，都是元培先生創(chuàng)造出來的�！敝醒胙芯吭旱某煽�(jī)得到外國(guó)同行的認(rèn)可。1932年，法蘭西學(xué)院贈(zèng)與中央研究院白里安獎(jiǎng)金；1934年7月，波斯的亞細(xì)亞學(xué)院將中央研究院列為名譽(yù)會(huì)員。
　　“九一八”事變后，蔡元培認(rèn)為在此國(guó)難之際，保障民權(quán)尤為必要，只有民權(quán)得到保障，全國(guó)上下才能精誠(chéng)團(tuán)結(jié)，共赴國(guó)難。為此他與宋慶齡、鄧演達(dá)等發(fā)起成立了中國(guó)民權(quán)保障同盟，并任同盟副主席。蔡元培在同盟成立大會(huì)上指出：
　　本同盟之目的：（一）為國(guó)內(nèi)政治犯之釋放與非法的拘禁、酷刑及殺戮之廢除而奮斗。本同盟愿首先致力于大多數(shù)無名與不為社會(huì)注意之獄囚；（二）予國(guó)內(nèi)政治犯以法律及其他之援助，并調(diào)查監(jiān)獄狀況，刊布關(guān)于國(guó)內(nèi)壓迫民權(quán)之事實(shí)，以喚起社會(huì)之公意；（三）協(xié)助為結(jié)社集會(huì)自由、言論自由、出版自由諸民權(quán)努力之一切奮斗。
　　同盟成立后，蔡元培、宋慶齡等人四處奔走，先后營(yíng)救過牛蘭夫婦、陳獨(dú)秀、許德珩、廖承志、羅登賢、余文化、丁玲、潘梓年等人，保護(hù)了許多政治犯。
　　中國(guó)民權(quán)保障同盟在北平設(shè)立分會(huì)，擴(kuò)大其影響力。國(guó)民黨當(dāng)局不能容忍同盟的活動(dòng)，急欲除之而后快，但鑒于蔡元培、宋慶齡的特殊身份，不敢打他們的主意，便向同盟的第三號(hào)人物楊杏佛下了毒手。楊杏佛遇害后，中國(guó)民權(quán)保障同盟的活動(dòng)被迫停止，不久該組織無形消散。蔡元培沒有因此而停止?fàn)幦∶駲?quán)的斗爭(zhēng)，仍然盡己所能保護(hù)革命志士。
　　魯迅逝世后，蔡元培頂住壓力，親自主祭魯迅葬禮，號(hào)召人們“要踏著前驅(qū)的血跡，建造歷史的塔尖”，“使魯迅先生的精神永遠(yuǎn)不死”。1938年，《魯迅全集》出版時(shí)，蔡元培作序，盛贊魯迅：“先生閱世既深，有種種不忍見不忍聞的事實(shí)，而自己又有一種理想的世界，蓄積既久，非一吐不快”�！八�的感想之豐富，觀察之深刻，意境之雋永，字句之正確，他人所苦思力索而不易得當(dāng)?shù)模�他就很自然的寫出來，這是何等天才！又是何等學(xué)力！”其著述“蹊徑獨(dú)辟，為后學(xué)開示無數(shù)法門，所以鄙人敢以新文學(xué)開山目之”。
　　日軍入侵上海，蔡元培舉家逃亡香港，雖年老體衰，他卻念念不忘祖國(guó)抗日大業(yè)，任國(guó)際反侵略大會(huì)中國(guó)分會(huì)名譽(yù)主席，一首《滿江紅》，砥礪士氣。1940年3月5日，病逝于香港，極具哀榮。
　　1936年，蔡元培已是古稀老人。一年前，他辭去一切兼職，極少參加社交活動(dòng)，在家頤養(yǎng)天年。這年，蔡元培的朋友、學(xué)生以各種形式慶賀他的七十壽辰。蔣夢(mèng)麟、胡適等人發(fā)起為其籌資建屋的活動(dòng)，后因日軍入侵未果。
　　1月11日，中央研究院舉行慶典，祝賀蔡元培七十壽辰。1月19日，中國(guó)科學(xué)社上海社友在靜安寺路萬國(guó)總會(huì)舉行酒會(huì)，為蔡元培賀壽。2月1日晚，旅滬北京大學(xué)同學(xué)50多人在滄州飯店為蔡元培慶祝七十大壽，并敬送壽屏。2月9日晚，黃炎培、何應(yīng)欽、張學(xué)良、顧維鈞、杜月笙、沈鈞儒、柳亞子等170多人與中華職業(yè)教育社、鴻英教育基金董事會(huì)、東方文化協(xié)會(huì)、上海美專校董會(huì)等6個(gè)團(tuán)體在國(guó)際飯店為蔡元培祝壽，孫科致祝詞。2月16日，南京北京大學(xué)同學(xué)會(huì)在中央飯店舉行春季聚餐會(huì)，慶祝蔡元培七十壽辰。2月23日，上海學(xué)術(shù)界胡樸安、舒新城等發(fā)起征集學(xué)者文人撰寫論文、詩(shī)詞及繪畫，匯刊慶祝蔡元培七十歲、柳亞子五十歲的《蔡柳二先生壽辰紀(jì)念集》一冊(cè)。4月23日，國(guó)立音樂專科學(xué)校師生舉行演奏會(huì)，慶祝蔡元培七十誕辰。這次演奏會(huì)實(shí)況由上海廣播電臺(tái)經(jīng)南京中央廣播電臺(tái)轉(zhuǎn)播全國(guó)。
　　蔡元培風(fēng)風(fēng)光光地過完了七十壽辰。但畢竟歲月不饒人，年老體弱的蔡元培，生日之后不久，就大病一場(chǎng)，幸而及時(shí)搶救，才轉(zhuǎn)危為安。
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