第二段人生：抗清復(fù)明，板蕩忠臣
　　朱舜水從二十歲（萬歷四十七年）到四十歲（崇禎十二年）的二十年間，正是清兵大舉入主中原的時(shí)期，他懷著強(qiáng)烈的民族正義感，積極參加了抗清斗爭(zhēng)，是明末最有民族氣節(jié)的知識(shí)分子之一。
　　弘光隆武元年（1645）五月，清兵攻陷南京，福王出走。福王敗亡后，明室產(chǎn)生了兩個(gè)領(lǐng)導(dǎo)力量，即唐王和魯王。不久，清兵攻取福建，殺了唐王。此時(shí)，魯王率領(lǐng)部下進(jìn)攻南澳島，然后又攻取舟山群島。這期間，朱舜水幾次往返于日本與舟山之間。在舟山時(shí)，他和經(jīng)略直浙兵部左侍郎王翊深相締結(jié)，并且與舟山諸將密商恢復(fù)明朝的方策。他之所以屢次去日本，是想仿效申包胥，借日本援兵資助王翊，以恢復(fù)中原。
　　魯王監(jiān)國(guó)五年（1650），清順治七年，朱舜水漂浮海上，被清兵發(fā)現(xiàn)。清軍白刃合圍，逼迫他髡發(fā)投降，但他談笑自若，毫不懼怕，誓死不降。同舟劉文高等人被他的義烈所感動(dòng)，駕舟將他送回舟山。次年，他又去日本，以后又由日本到安南（今越南）。監(jiān)國(guó)九年，魯王降詔征他，他因東西漂泊，住處不定，不能很快到達(dá)。魯王在詔書中責(zé)備他“托諭占城，去而不返，背君茍免，史氏譏之”。魯王希望他盡快回國(guó)效力。朱舜水手捧詔書唏噓感慨，想轉(zhuǎn)赴思明（今廈門）返回舟山。恰恰這時(shí)，安南國(guó)王需要識(shí)字的人擔(dān)任書記之職，有人推薦朱舜水，府吏便將他捉到官府去，面試作詩寫字。他不肯作詩，只寫道：“朱舜水，浙江余姚人，南直松江籍。因中國(guó)折柱缺維，天傾日喪，不甘薙發(fā)從虜，逃避貴邦，至今一十二年，棄捐墳?zāi)蛊拮�。虜氛未滅，�?guó)族難歸。潰耄憂焚，作詩無取。所供是實(shí)�！备�吏將他拘囚起來，嚴(yán)密監(jiān)視他。后來安南國(guó)王召見他，他不肯下拜，激怒了國(guó)王和文武大臣，認(rèn)為他挾中國(guó)的威勢(shì)，欺凌小國(guó)，一定要?dú)⑺�。同行的人也都勸他跪拜。但朱舜水大聲說：前天從會(huì)安來的時(shí)候，已經(jīng)和親友作過死別了。今日我為遵守禮節(jié)而死，毫無遺憾。安南國(guó)王天天派人在朱舜水寓所附近殺人，先梟其首，再收骨肉剁碎，拋撒滿場(chǎng)，招致鳥鳶犬豕競(jìng)來就食，以此來恐嚇?biāo)�。但他絲毫不懼怕，最終感動(dòng)了安南國(guó)王，不但不殺他，反而請(qǐng)求他在安南做官，以“太公佐周而周王，陳平在漢而漢興”相誘，但朱舜水始終不答應(yīng)。安南國(guó)王派人寫一“確”字，探問他的意思，他作一篇《堅(jiān)確賦》回復(fù)安南國(guó)王，以表自己忠于大明王朝的堅(jiān)貞志操。朱舜水在安南的遭遇證明了他不愧是一位愛自己祖國(guó)的讀書人。他說：“仆事事不如人，獨(dú)于‘富貴不能淫，貧賤不能移，威武不能屈’，似可無愧于古圣先賢萬分之一。一身親歷之事，固與士子紙上空談?wù)弋愐��！敝焖此�生�?dāng)民族危難之秋，保持了海外赤子之心。由于無交通工具，朱舜水困于安南，只得先回復(fù)魯王一封信，陳述他歷年海外經(jīng)營(yíng)，籌資覓餉的苦心。
　　當(dāng)他要從安南返回舟山時(shí)，舟山和四明山寨都被清軍攻陷了。魯王返回廈門，朱舜水的摯交師友王翊蒙難。王翊被清兵擒后，在獄中照常整冠掠發(fā)，毫無愁容。清獄卒問他什么緣故，他說，叫你們見識(shí)見識(shí)漢官的威儀。清軍因懷恨王翊的積年倔強(qiáng)，許多人集合起來，用亂箭將他射死。他至死傲然挺立，面不改色。王翊殉難那天，正是農(nóng)歷中秋節(jié)。消息傳來，朱舜水大為悲痛。為了紀(jì)念好友，從此“終生廢中秋賞月”。
　　屢受挫折，朱舜水的處境越來越艱難。但他抗清的意志始終不變，復(fù)明的決心至死不衰。他繼續(xù)奔走海上，募捐抗清。當(dāng)時(shí)鄭成功在廈門準(zhǔn)備與張煌言會(huì)師入長(zhǎng)江，他應(yīng)鄭成功的邀請(qǐng)，參加了這次戰(zhàn)役。收復(fù)瓜州，攻下鎮(zhèn)江，朱舜水都親歷行陣。但這次行動(dòng)最終遭到了失敗。朱舜水考量當(dāng)時(shí)的局勢(shì)，不禁浮起了這樣一個(gè)悲壯的念頭：聲勢(shì)不可敵，失地不可復(fù)，與其在內(nèi)地作異族的奴隸牛馬，不如蹈海全節(jié)，以保民族正氣。最后，六十歲的朱舜水東渡日本，留居長(zhǎng)崎。這年正是永歷十三年（1659），清順治十六年。
　　朱舜水定居日本時(shí)，每日向南而泣血，背北而切齒。正如黃遵憲在《日本雜事詩》中所描述：“海外遺民意不歸，老來東望淚頻揮；終身恥食興朝粟，更勝西山賦采薇。”朱舜水自稱是大明的“遺臣”，年近八十還寫信囑咐子孫：寧可“自食其力”，也不能去做“清朝官”。他到日本后的第三年，即明亡后的第十七年，總結(jié)明亡的教訓(xùn)，提出抗清的方略，寫下了著名的《中原陽九述略》這篇著作。為迎來中原光復(fù)的一天，他節(jié)儉開支，死時(shí)居然儲(chǔ)備了三千余金，作為復(fù)國(guó)的經(jīng)費(fèi)。朱舜水抗清復(fù)明的彤彤赤心，真可謂驚天地、泣鬼神。