準(zhǔn)噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站前身為“新疆荒漠生態(tài)定位研究站”，1984年，由原國家環(huán)保局批準(zhǔn)了原新疆環(huán)保所（現(xiàn)新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護(hù)科學(xué)研究院）“荒漠生態(tài)定位研究”課題立項(xiàng)后建立，經(jīng)過10年的野外生態(tài)觀測研究，取得了豐碩的科研成果。1994年課題結(jié)束后，因缺乏持續(xù)科研經(jīng)費(fèi)投入，該站除保留4.3km2觀測研究用地和舊站建筑物之外，全部科研工作處于停滯狀態(tài)，原有的觀測研究硬件設(shè)備全部報(bào)廢淘汰。2010年新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護(hù)科學(xué)研究院院領(lǐng)導(dǎo)班子調(diào)整之后，新一屆院領(lǐng)導(dǎo)班子確立了“科研立院、人才強(qiáng)院、特色興院”的發(fā)展思路，并決定重建野外觀測研究站，定名為“新疆準(zhǔn)噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站”，主要任務(wù)是基于生態(tài)基線調(diào)查，建立環(huán)境背景數(shù)據(jù)庫，開展生態(tài)環(huán)境現(xiàn)狀及生物多樣性定位觀測研究。經(jīng)過充分調(diào)研和論證，結(jié)合新疆當(dāng)前社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展的現(xiàn)狀和生態(tài)環(huán)境保護(hù)工作的實(shí)際需求，確定了“以烏魯木齊河為主線，從天山一號(hào)冰川到東道海子垂直分布帶生態(tài)系統(tǒng)、準(zhǔn)噶爾盆地南緣荒漠綠洲交錯(cuò)帶生態(tài)演變和重大人為活動(dòng)對綠洲荒漠生態(tài)環(huán)境影響”三大方向觀測研究定位，并于2010年下半年開始邊建設(shè)邊觀測研究。2011年6月底，環(huán)境保護(hù)部周生賢部長視察新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護(hù)科學(xué)研究院，聽取新疆準(zhǔn)噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站工作匯報(bào)后，給予了充分肯定，并要求將其納入國家環(huán)境保護(hù)野外觀測研究體系。2012年，該觀測研究站經(jīng)環(huán)境保護(hù)部批準(zhǔn)正式納入中國環(huán)境科學(xué)研究院野外生態(tài)環(huán)境觀測研究站體系，由中國環(huán)境科學(xué)研究院與新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護(hù)科學(xué)研究院共同建設(shè)運(yùn)行，全面開展生態(tài)環(huán)境長期綜合觀測。
　　觀測站位于準(zhǔn)噶爾盆地南緣，北靠古爾班通古特沙漠，南依烏魯木齊河、頭屯河及三屯河下游綠洲，是典型的荒漠綠洲交錯(cuò)帶；地理坐標(biāo)范圍為44029，26”~44030728”N，87030748”~87032r36”E，海拔430m，占地面積4.3km2，距烏魯木齊直線距離85km。以烏魯木齊河流域（一號(hào)冰川一東道海子）完整的垂直帶譜為觀測范圍，以荒漠綠洲交錯(cuò)帶和國家經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)甘泉堡工業(yè)園區(qū)為重點(diǎn)觀測區(qū)域，以植被、土壤、地下水、大氣、氣候等生態(tài)環(huán)境要素的綜合觀測為主要觀測內(nèi)容，以荒漠生態(tài)系統(tǒng)演替、生態(tài)水文過程、生物多樣性、生態(tài)環(huán)境對氣候變化和人類活動(dòng)的響應(yīng)為重點(diǎn)研究方向，探索準(zhǔn)噶爾盆地荒漠生態(tài)系統(tǒng)演變規(guī)律以及區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展對生態(tài)環(huán)境的影響，為環(huán)境保護(hù)應(yīng)用研究及環(huán)境管理提供技術(shù)支撐。通過觀測站的基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)和觀測研究能力建設(shè)，逐步形成具有荒漠生態(tài)學(xué)、綠洲生態(tài)學(xué)及污染生態(tài)學(xué)等學(xué)科的研究能力，形成多尺度、全面、長期連續(xù)監(jiān)測、模擬和解決多學(xué)科的關(guān)鍵科學(xué)問題的能力，為生態(tài)環(huán)境管理提供基礎(chǔ)科學(xué)支撐。最終把觀測站建成具有國內(nèi)先進(jìn)水平的基礎(chǔ)性、綜合性、長期性生態(tài)學(xué)與環(huán)境科學(xué)觀測的研究基地，先進(jìn)的科技成果試驗(yàn)、示范基地，優(yōu)秀的科學(xué)人才培養(yǎng)基地，高度開放的國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流基地。
　　新疆準(zhǔn)噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站重建以來，對烏魯木齊河流域的野生動(dòng)植物資源進(jìn)行了4年的觀測調(diào)查，調(diào)查范圍沿烏魯木齊河，從一號(hào)冰川一大西溝水庫一烏拉泊水庫一青格達(dá)湖一觀測站一東道海子（見烏魯木齊河流域范圍圖），包括冰雪裸巖帶、高山墊狀植被帶、高山亞高山草甸帶、中山針葉林帶、山地草原及灌木草甸草原帶、荒漠草原帶、荒漠帶、沙漠植被帶等完整的植被垂直帶，開展12條樣線，50多個(gè)樣地的觀測和調(diào)查。重點(diǎn)調(diào)查了陸生脊椎動(dòng)物繁殖期（夏季）、遷徙期（春、秋兩季）的群落，物種的構(gòu)成、生活習(xí)性，以及植被群落的空間格局、物種構(gòu)成、蓋度、多度、生物量等指標(biāo)，采集500余株植物，制作植物標(biāo)本119種，制作動(dòng)物標(biāo)本20余件。